酵母转录因子结合位点保守性生物信息学研究.docVIP

酵母转录因子结合位点保守性生物信息学研究【摘要】目的：本研究拟发掘出酵母基因组中转录因子结合位点的保守性位点和规律。方法：本研究采用生物信息学中保守性模体参数Mi分析基因上游不同区域与真核生物转录因子结合位点保守性之间的关系。结果：转录因子Sok2、Swi4结合位点的保守性在基因转录起始位点上游各个区间的差异主要由其本身的序列特性决定。此外，本研究分别发掘出转录因子Sok2、Swi4结合位点的保守性位点。结论：本研究结果有助于提供新的参数用以改进现有预测转录因子结合位点的方法，在此基础上为深入研究真核生物的转录水平调控模式奠定理论基础。 【关键词】酵母; 转录因子; 结合位点；保守性；生物信息学 真核基因的表达调控可在多个层次上进行，但主要表现在对基因转录活性的调控上[1]。转录因子与对应DNA序列结合调控其目标靶基因的表达是基因表达调控的核心问题,因此转录水平的调控是真核基因表达最基本的调控方式[2]。转录因子不但可以结合在DNA序列上调控基因转录的起始，同时也可以招募组蛋白修饰酶，对转录因子结合位点附近的组蛋白进行修饰，而组蛋白修饰又可以促进DNA与转录因子的结合，还可能产生新的转录因子结合位点。正是由于不同发育阶段特异、细胞特异的反式作用因子与相应DNA调节元件的结合，导致了基因的差异表达[3]。 本研究以真核模式生物酵母的转录因子为研究材料，从酵母基因组的