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- 2017-08-10 发布于辽宁
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找外显子内含子
利用UCSC来寻找外显子\内含子
来源: 发布时间:2009-08-06 查看次数:724
以人类的 wnt3a 基因为例,该种方法适合进行引物设计,很直观地跨内含子设计引物.
二、/
1、 进入 / 的网页
2、点击 Gene Sorter
3、在 genome 栏输入 human,在 search 栏输入 wnt3a,点击 go
4、出现下图,点击Description,即图中圈出来的部分:
5、出现下图,点击 sequence
6、出现下图,点击 Genomic
7、出现下图,选择以下选项,点击 submit
?
?
8、出现序列,其中外显子用大写字母,内含字用小写字母。
?
9、将其拷贝到 word 中,鼠标定位到大小写接头的位点,进行定位统计。 应用ensembl网站寻找基因外显子、内含子
来源: 发布时间:2009-08-06 查看次数:1082
以人类的 wnt3a 基因为例
三、/
1、 进入 / 网页
2、在 search 栏中选择 homo sapiens,在 for 栏输入 wnt3a,点击 go
3、出现下图,点击图中圈出的部分。
4、出现下图,点击 exon information
?
5、出现下图。从图中我们得知 wnt3a基因位于1号染色体上,从 226261375~226315584结束。共有 4 个外显子,三个内含子。
? 应用NCBI查找基因的内含子与外显子
来源: 发布时间:2009-08-06 查看次数:969
以人类的 wnt3a 基因为例
一、/entrez/query.fcgi?CMD=searchDB=gene
1、进入 ncbi 的 gene 数据库
【网址:/entrez/query.fcgi?CMD=searchDB=gene】
?
2、在 for 栏输入 wnt3a,点击 limits
3、在 All fields 栏选择 Gene Name,在 Homo sapiens 前打勾,点击 go
4、出现下图,点击 wnt3a
5、鼠标左键点击 NC-000001.9,选择 Genbank
或在 Genomic 栏下点击 Genbank【图中圈出的部分】
6、出现下图,图中画线部分就是外显子的位点【注意不是图中圆圈的部分】
外显子分别为 1~149
15617~15858
43606~43871
51936~54210
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