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奥美拉唑对人脐静脉内皮细胞全基因表达谱的影响 - 南方医科大学学报.pdf

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奥美拉唑对人脐静脉内皮细胞全基因表达谱的影响 - 南方医科大学学报

·472 · 南方医科大学学报(J South Med Univ ) 2012;32(4) 基础研究 奥美拉唑对人脐静脉内皮细胞全基因表达谱的影响及机制分析 1, 2 1 1 1 1 3 刘先锋 ,卢学春 ,范 利 ,高 燕 ,马 聪 ,罗 芸 1 3 2 解放军总医院 南楼血液科,老年病研究所细胞生物学研究室,北京 100853;解放军第401 医院干部病房三 科,山东 青岛 266071 摘要:目的研究奥美拉唑对体外培养人脐静脉内皮细胞(EA.hy926)基因表达谱的影响,探讨奥美拉唑对内皮细胞作用的分子 -5 机制。方法10 mol/L 奥美拉唑与人脐静脉内皮细胞株共培养48 h ,运用Affymetrix U 133 plus 2.0 全基因组表达芯片,检测奥 美拉唑对人脐静脉内皮细胞基因表达谱的影响,分子注释系统MAS3.0 软件进行聚类分析。RT-PCR 验证基因表达谱结果, Western blotting 验证相关蛋白水平的变化。结果奥美拉唑作用内皮细胞48 h 后,基因芯片分析筛选出差异表达大于1.5倍的 基因282 个,其中上调基因236 个,下调基因46 个,包括转录调节、炎症反应、免疫反应、细胞粘附、抗凋亡、信号转导等相关基因, RT-PCR 和Western blotting 结果与基因芯片结果一致。结论奥美拉唑在基因水平通过多条通路调节内皮功能。 关键词:奥美拉唑;内皮细胞;生物信息学;基因表达 中图分类号:R975.6; R34 文献标志码:A 文章编号:1673-4254(2012)04-0472-05 doi: 10.3969/j.issn. 1673-4254.2012.04.007 /kcms/detail/44.1627.R1030.001.html Effect of omeprazole on gene expression profile of human umbilical vein endothelial cell line and bioinformatics analysis 1,2 1 1 1 1 3 LIU Xianfeng , LU Xuechun , FAN Li , GAO Yan , MA Cong , LUO Yun 1Department of Geriatric Hematology, 3Laboratory of Cell Biology, Institute of Gerontology and Geriatrics, General Hospital of PLA, Beijing 100853, China; 2401 Hospital of PLA, Qingdao 266071, China Abstract: Objective To characterize the effect of omeprazole on the spectrum of gene expression in the cultured human umbilical vein endothelial cell (HUVEC) line (EA.hy926), and explore the underlying molecular mechanism. Methods Affymetrix U133 plus2.0 oligonucleotide microarray was used to detect the alteration in the gene expression profiles induced by 1×10-5 mol/L omeprazole in HUVEC

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