疣猴亚科相关毛色基因分析和川金丝猴SNP位点筛选.pdfVIP

疣猴亚科糯关毛色蒸圜分析及 川金缝猴SNP位点筛选 毒虫菇霉雾： 动葶努。jj≯ 审请著戈：蕊鬟翻： 论文答瓣委受会 主眵，施一 委妒至丝垒。． …量羔整… …銎量，趟． 一…≮≯——*一…1一二。 i 。；，：；ilil；i}!：：：：：!醛—。～、—、、，—、、、～一 疣猴亚科相关毛色基因分析及川金丝猴SNP位点筛选 研究生：杜丽娜 年级：2012级导师：周岐海教授 IlUl 学科专业：动物学研究方向：动物生理生态学IIIIIIIIIIIIl UUI 0 Y284—651 摘甄 毛色作为动物一个十分重要的形态特征，其丰富的性状主要是由黑色素决定的。黑色 素有真黑素和褐黑素两种类型。目前，国内外已有很多关于动物相关毛色基因的研究。疣 猴亚科是灵长类猴科的两个亚科之一，主要分布在非洲和东南亚的森林中，其物种的毛色 均有明显的特征，但是关于疣猴亚科物种毛色差异的研究暂未见有报道。本研究第一部分 对引起疣猴亚科毛色差异的相关毛色基因进行了初步探讨，以期能够对其适应性进化研究 提供一些帮助基础信息。主要研究结果如下： 通过PCR扩增、分子克隆等方法成功获得了东黑白疣猴、黑脊叶猴、JI『金丝猴、长鼻 测序结果比对拼接，获得它们完整的编码区序列，并对这七个相关毛色基因在疣猴亚科七 个物种中发生的碱基和氨基酸突变进行了分析；采用PAMLX软件分别对七个相关毛色基 因进行位点模型计算，在MLPH基因中发现第272个密码子受到正选择作用，我们推测 MLPH基因第272个密码子的突变可能是形成疣猴亚科毛色差异的原因之一。 』Il金丝猴属于疣猴亚科金丝猴属，是中国特有的珍稀濒危灵长类物种，同时也是中国 生物保护的旗舰物种。因为人类活动的影响和捕猎，其种群数量受到了严重的威胁。为了 更好的管理和保护川金丝猴，科学家们运用了各种分子标记如线粒体标记、微卫星标记等 对川金丝猴的保护遗传学进行了各种研究。本研究第二部分采用了一种新技术(HRM)， 对川I金丝猴的SNP位点进行基因分型，并将筛选的SNP位点用于川金丝猴的个体识别。 主要研究结果如下： 我们共获得了124个候选SNP位点，根据候选SNP位点的上下游序列设计合成了85 分型；对37个SNP位点的七只川金丝猴个体的血液DNA样品的HRM分型进行了验证， 的基因型，使用cervus 便样品来自于7只川金丝猴个体；对34个SNP位点的个体识别能力进行估算，34个SNP 等人的研究构建SNP位点个体识别能力估算模型，34个SNP位点最高可识别的个体数为 点有足够的能力识别所有川金丝猴种群。 关键词：疣猴亚科；川金丝猴；毛色基因； SNP；HRM：个体识别 Ⅱ CoatColorGenesand Relatedto ofColobinae Analysis ofSNPsin roxellana Selection Rhinopithecus