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幽门螺杆菌iceA1,babA2基因型与临床消化疾病的关系.doc
幽门螺杆菌iceA1,babA2基因型与临床消化疾病的关系
【摘要】 目的: 研究镇江地区幽门螺杆菌(H.Pylori)iceA1, babA2基因型分布及其与临床消化疾病的关系。方法: 从70例胃十二指肠疾病患者胃黏膜活检组织中分离培养H.Pylori,PCR扩增检测H.Pylori iceA1, babA2基因型。用χ2检验分析各基因在不同胃十二指肠疾病中的统计学意义。 结果: 70例菌株的总检出率分别为iceA1 68.6%,babA2 65.7%。其中iceA1的分布为胃癌12/14(85.7%),慢性胃炎18/30(60%),消化性溃疡18/26(69.2%);而babA2的检出率为胃癌8/14(66.7%),慢性胃炎19/30(63.3%),消化性溃疡19/26(73.1%)。 结论: 镇江地区分离的H.Pylori的iceA1与babA2基因与胃癌、消化性溃疡、慢性胃炎等疾病类型的发生无显著相关性,但iceA1在胃癌中的检出率高于慢性胃炎与消化性溃疡患者。
【关键词】 幽门螺杆菌; iceA1基因; babA2基因; 上消化道疾病
[Abstract] Objective: To investigate the distribution of iceA1 and babA2 genes of Helicobacter pyloric(H.Pylori) in Zhenjiang area and the relationship bet the patients erase Chain Reaction(PCR). The results a patients, in 18/30(60%) of peptic ulcer patients, in 18/26(69.2%) of chronic gastritis patients. babA2 a patients, in 19/30(63.3%) of peptic ulcer patients, in 19/26(73.1%) of chronic gastritis patients. Conclusion: No association of different clinical diseases gastric carcinoma patients 以内)活检组织,每例取新鲜胃黏膜3块,其中1块置于输送液中用于H.Pylori 分离培养与胃黏膜DNA提取,1块用于快速尿素酶检测,1块用于病理组织学检查。70例中慢性胃炎30例,消化性溃疡26例,胃癌14例。疾病的诊断依据胃镜和病 理学 检查。
1.2 H.Pylori的培养与鉴定
自输送液中取出胃黏膜标本,以接种环轻轻将组织置于固体培养基上(4%基础培养基加无菌全羊血及选择性抗生素)反复涂抹后,于37 ℃微氧条件下培养3~5 d,经菌落形态、涂片染色显微镜下观察以及生化反应(尿素酶,氧化酶和触酶)证实。
1.3 基因组DNA提取
按标准PBS/氯仿,异戊醇法抽提基因组DNA[3]。
1.4 引物设计
以已知iceA1基因(登录号AF 459446.1)及babA2基因(登录号AF 033654.1)分别设计引物,引物序列和扩增片段长度见表1。引物均由上海生物工程公司合成。
1.5 PCR反应
PCR总体积均为20 μl。dNTP和Taq聚合酶购自TakaRa宝生物工程(大连)有限公司。反应体系如下:10×PCR 缓冲液 2.0 μl,Taq酶0.3 μl,P1 引物 0.5 μl,P2 引物 0.5 μl,cDNA 1 μl,dNTP 2.0 μl,ddH2O 14.7 μl。iceA1扩增条件:94 ℃预变性5 min,94 ℃ 30 s,53.7 ℃ 20 s,72 ℃ 30 s,35个循环;最后72 ℃延伸10 min。babA2扩增条件:94 ℃预变性5 min,94 ℃ 30 s,57.7℃ 40 s,72 ℃ 45s,35个循环;最后72 ℃延伸10 min。反应在BroRad公司的MyCyer PCR仪上进行,以1.2%琼脂糖凝胶电泳检测。PCR产物送上海英骏生物技术工程有限公司测序,测序结果与PubMed 上公布的H.Pylori序列进行对比分析。表1 iceA1和babA2基因的PCR引物
1.6 统计学分析
SPSS13.0统计软件进行χ2检验。
2 结 果
2.1 扩增结果
iceA1和babA2获得目的大小的PCR产物(图1和图2)。
2.2 iceA1及babA2基因的检出率
镇江地区iceA1, babA2基因型检测结果显示,70株H.Pylori中iceA1总阳性率为68.6%,babA2总阳性率为65.7%。iceA1
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