一种新型肿瘤组织起源分子标志物的建立与评价.pdfVIP

中@疆盘À各 却16年第却卷第10;期 中 《 》 801 801 αmAlONrou盹{ 211 n6 VoU6 No. 1I!lI N N O 杜 祥 ，复旦大学附属肿瘤医院主任医师、教授、博士生导 师。现任中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会候任主委、中国研 究型医院学会病理学专业委员会主任委员、中国医师协会病理 科医师分会副会长、中华医学会病理分会常委；中国医学装备 协会病理装备技术专业委员会副主任委员、国家标准委全国生 物样本技术委员会副主任委员、中国医药生物技术协会组织样 本库分会副主任委员。从事肿瘤的病理诊断工作26年，围绕 恶性肿瘤发生机制、分子分型及诊断预后标志物等方面开展研 究。2007年至今在国内外医学专业期刊上以通信作者发表论文 48篇；多次获得中国抗癌协会科技奖、教育部科技进步奖和上 海市科技进步奖；承担国家自然科学基金、上海市基础研究重 大项目和重点项目及其他各类科研项目10余项，目前作为课题第一负责人承担国家自 然科学基金、上海市基础研究重点项目、卫生部临床重点专科项目等在研课题7项。 一种新型肿瘤组织起源分子标志物的 建立与评价 1 2 2 2 3 1 王奇峰 ，徐清华 ，陈金影 ，钱琛晖 ，刘晓健 ，杜 祥 1. 复旦大学附属肿瘤医院病理科，复旦大学上海医学院肿瘤学系，上海 200032 ； 2. 杭州可帮基因科技有限公司，浙江 杭州 311188 ； 3. 复旦大学附属肿瘤医院化疗科，复旦大学上海医学院肿瘤学系，上海 200032 ［摘要］ 背景与目的：原发灶不明恶性肿瘤是一类转移性肿瘤的统称，在诊断时无法找到原发位点，约 占所有恶性肿瘤的5%~10%。明确肿瘤的组织起源对于患者的诊断和治疗具有重要意义。方法：整合ArrayEx- press和Gene Expression Omnibus数据库中肿瘤类型明确的样本数据，构建涵盖22种常见肿瘤类型、5 800例样本 的基因表达谱数据库；通过支持向量机递归特征消除算法筛选组织特异性基因，建立肿瘤分类模型；采用实时 (real-time quantitative polymerase chain reaction RTQ-PCR) 定量聚合酶链反应 ， 检测石蜡包埋肿瘤组织中基因的 表达水平，并将基因分型结果与病理诊断结果进行比较。结果：基于肿瘤基因表达谱大数据，筛选出96个组织 特异性基因，其中包含常见的肿瘤相关基因，如钙黏蛋白1(cadherin 1 ，CDH1)、激肽释放酶相关酶3(kallikrein- related peptidase 3 KLK3) (epidermal growth factor receptor EGFR) 206 ， 和表皮生长因子受体