线粒体d2loop序列变异与东方鲀属鱼类系统发育-水生生物学报.pdfVIP

第 33卷 第 4 期 水 生 生 物 学 报 Vo l3 3 , No 4 2 0 0 9 年 7 月 ACTA HYDROB IOLO GICA SIN ICA Ju l, 2 0 0　9 DO I号 : 103724 / SPJ 0000200940656 线粒体 D loop序列变异与东方鲀属鱼类系统发育 1, 2 1 1 张玉波 　甘小妮 　何舜平 ( 1 中国科学院水生生物研究所 ,武汉 　430072; 2 中国科学院研究生院 ,北京 　100039) ( ) 摘要 :东方鲀属的红鳍东方鲀 Tak if ug u rubrip es 是后基因组时代的一种重要模式生物 。本研究中 ,利用东方鲀属 ( ) 11种鱼类 18尾 的 D loop 基因序列 ,对东方鲀属鱼类的系统发育关系进行研究 。经序列比对排定后 ,分析中 ( ) D loop 序列有 84 1个位点 ,其中 395个位点为可变位点 , 267个位点为系统发育信息位点 。分别采用邻接法 NJ 、 ( ) ( ) ( ) 最大简约法 M P 、最大似然法 ML 和贝叶斯方法构建了分子系统树 。研究结果表明: 1 东方鲀属鱼类为一单系 ( ) ( ) ( ) 类群 ; 2 由横纹东方鲀 T oblong us 和铅点东方鲀 T a lbop lum beus 构成的姊妹群位于这个类群的基部 。此外 , 本属鱼类物种分类现状还需要进一步的澄清 。 关键词 :系统发育 ; D loop ;东方鲀属 中图分类号 : Q349 + 1　　文献标识码 : A 　　文章编号 :(2009) ( ) 　　东方鲀属 Tak if ug u Abe 是鲀形 目中一个区域 性分布的类群 ,主要分布区域从日本岛西部到中国沿 海 ,极少数可以分布到印度洋 [ 1—4 ] (图 1) 。据中国动 ( 物志记载 ,我国分布有 22种东方鲀属鱼类 其中包括 两个新种 , 而 fishbasehttp : / /wwwfishbaseorg 数据 ) 库中记载的有效种为 23个 ,分布在一些大的河 口 ( ) 区域 如珠江 、长江等河 口 和渤海 、黄海 、东海和南 海等海域 [ 4 ] 。从 20世纪 90年代开始 ,拥有 “简约 ” 基因组的红鳍东方鲀 ( T rubrip es ) , 成为后基因组