基于LC-MALDI的蛋白质组学技术建立与评价.pdfVIP

基于LC-MALDI的蛋白质组学技术建立与评价.pdf

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实验技术与管理 ISSN 1002-4956 第 33 卷第9 期 2016 年 9 月 CNII-2034/T Experimental Technology and Management Vo l. 33 No.9 Sep. 2016 001: 10. 16791/j. cnki. sjg. 2016. 09. 017 基于 LC-MALDI 的蛋白质组学技术建立与评价 陈默,王秋霞,郑颖,唐玲,周少霞,付鹏,马洪雨 〈南京农业大学植物保护学院,江苏南京 210095) 摘 要:建立了一套适用于 LC-MALDI 系统的标记定量蛋白质组学分析技术,主要包括蛋白提取、溶液内酶 解、肤段标记、液相分离、质谱检测、生物信息学分析等步骤。将该方法与传统的双向凝胶电泳技术进行了比 较与评价,该方法的实验结果可靠、灵敏度离、实验周期短.为今后的蛋白质组学研究工作提供了有效的参 考与借鉴。 关键词:蛋白质组学, LC-MALDI;发标记定量 中图分类号: Q51 文献标识码:A 文章编号: 1002-4956(2016月-0061-05 Establishment and evaluation for protωmics technology based on LC-MALDI Chen Mo , Wang Qiuxia , Zheng Ying , Tang Ling , Zhou Shaoxia , Fu Peng , Ma Hongyu (College of Plant Protection ,Nanjing Agricultural University , Nanjing 210095 , China) Abstract: This article sets up a set of quantitative proteomics analysis technology suitable for LC-MALDI system , including protein extraction , solution hydrolases , peptides labeling , liquid phase separation , mass- spectrum detection. bioinformatics analysis , etc. At the same time , this article compares it with two- dimensional electrophoresis protocol and presents an assessment which has advantages of reliable experimental results ,high sensibility and short test period. It provides an effective reference for proteomics research. Key words: proteomics; LC-MALDI; quantitative labeling 1 蛋白质组学技术简介 术和双向荧光差异凝胶电泳技术;另一种是基于色谱 分离,结合质谱检测完成蛋白的定性和定量分析,主要 蛋白质组学研究是从整体水平上对蛋白质的表达 包括标记定量技术和非标定量技术问。最传统、最经 和功能进行分析[汀,使人们对生命系统与活动分子机

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