高通量dna测序数据的生物信息学方法-信息通信学术期刊网.pdfVIP

76 BIG DATA RESEARCH 大数据 高通量DNA测序数据的 生物信息学方法 1 2 3 詹晓娟 ，姚登举 ，朱怀球 1. 黑龙江工程学院计算机科学与技术学院，黑龙江 哈尔滨 150050； 2. 哈尔滨理工大学软件学院，黑龙江 哈尔滨 150040；3. 北京大学生物医学工程系，北京 100871 摘要 高通量测序技术产生的DNA序列数据长度较短，而且数据量非常巨大。分析了高通量测序环境下大数据的 挑战和机遇，总结并讨论了数据压缩、宏基因组数据序列拼接、宏基因组数据序列分析方面的算法和工具 等研究成果。最后，展望了高通量测序下DNA短读序列数据研究的发展趋势。 关键词 高通量DNA测序；生物信息学；短读序列数据压缩；短读序列数据拼接；短读序列数据分析 中图分类号：TP399