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中药废水污泥群落结构解析中PCR-DGGE引物的选择与评价
32 5 Vol . 32 ，No . 5
第 卷第 期 环 境 科 学
20 11 5 May ，20 11
年 月 ENVIRONMENTAL SCIENCE
中药废水污泥群落结构解析中PCR-DGGE 引物的选
择与评价
1 ，2 1 1 1*
， ， ，
林海龙 李伟光 闫险峰 任南琪
(1. ， 150090 ;2 . ，
哈尔滨工业大学城市水资源与水环境国家重点实验室 哈尔滨 哈尔滨师范大学生命科学与技术学院 哈尔
滨 150025 )
: DGGE ， 16 S rDNA
摘要 在中药废水生物活性污泥群落 解析过程中 为了探讨 通用引物的扩增效率和对污泥细菌群落的表征
， 11 16 S rDNA 4 ， DGGE
能力 选用包括简并性引物在内的 对通用引物扩增 序列的 个可变区 并应用 图谱评价不同引物的扩增
. ， DGGE ， ， V3
效率和微生物种群多样性 结果表明 采用不同引物对进行 分析时 微生物种群多样性存在着显著的差异 其中 和
V6 ～ V8 ， ， ， ， V 1 ～ V3 V3 ～
可变区分辨率较高 图谱中条带丰富 多样性较好 适合分析中药废水生物活性污泥群落的结构 而 和
V5 DGGE . ， 16 S rDNA V3 V6 ～ V8
可变区 图谱多样性较差 基于此 采用 的 和 区引物调查中药废水生物活性污泥群落都是适
， ， V6 ～ V8 (B968F / B140 1R); ，
宜的 若考虑到序列携带更多的分类信息 建议应用 可变区引物 为获得更高的群落多样性信息 建
V3 PCR DGGE .
议将简并和通用引物扩增的 区 产物等量混合后进行 分析
: ; ;16 S rDNA
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