草菇钙调磷酸酶催化亚基(Vv-CNA)的序列与表达.pdfVIP

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  • 2017-10-28 发布于湖北
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草菇钙调磷酸酶催化亚基(Vv-CNA)的序列与表达.pdf

南方农业学报 JournalofSouthernAgriculture ISSN 2095一】191;CODEN NNXAAB DOI:10.3969~:issn.2095-1191.2017.03.001 草菇钙调磷酸酶催化亚基( —CNA) 的序列与表达 汪健芳,徐志周,严俊杰,李 肖,张 磊,黄李琳,谢宝贵 (福建农林大学 菌物研究中心,福州 350000) 摘要:【目的】分析草菇钙调磷酸酶催化亚基(Vv-CNA)的序列与表达,为进一步探究草菇生长发育及子实体开伞 分子调控机理提供参考。【方法】通过生物信息学分析确定Vv-CNA基因的组成及保守结构,将ORFFinder预测的草菇 CNA氨基酸序列与从NCBI下载的其他真菌CNA氨基酸序列进行比对,并通过荧光定量PCR检测Vv-CNA基因在草菇 不同生长时期的相对表达量。【结果 】Vv-CNA基因编码区为2503bp,包含10个内含子(其中I2、I8、I9和I10存在内含子 保留现象),编码610个氨基酸,GenBank~录号KX463514。将Vv—CNA氨基酸序列与动物 (人、小鼠)、植物(拟南芥、水 稻)和真菌(曲霉、酵母等)的CNA氨基酸序列进行同源比对分析,结果发现Vv—CNA蛋白有3个最保守的结构域,与密 褐褶菌(G1oeophyllum gabeum)的亲缘关系最近。Vv-CNA~因在草菇子实体的蛋形期和伸长期高表达,以蛋形期的 相对表达量最高。 【结论】Vv-CNA基因编码钙调磷酸酶催化亚基 ,其高表达有利于草菇菌柄的伸长。 关键词:草菇;钙调磷酸酶催化亚基(CNA);基因结构;表达分析;菌柄伸长 中图分类号:$646.13 文献标志码:A 文章编号:2095—1191(2017)03—0381—05 ~一equenceand1eX13ressl●0n otncal’ci■neurl●n cata·llyt·ic‘SU1DUnl●t●l●n V_oJvariellavolvacea( CNA) WANGJian-fang,XUZhi-zhou,YANJun-jie,LIXiao,ZHANGLei, HUANGLi—lin,XIEBao-gui (MycologicalResearchCenter,FujianAgriculturalandForestryUniversity,Fuzhou350000,China) Abstract:【Objective】ThisresearchexploredsequenceandexpressionofcalcineurincatalyticsubunitinVolvariella volvaeea(Vv—CNA),inordertoprovidereferenceforgrowthanddevelopmentof volvaceaandrevealtheregulatory me— chanismoffruitbodies.【Method】ThesequenceandconservedstructureofVv-CNAwereanalysedbybioinofrmatics.An— ticipated VolvaceaCNA aminoacidsequencebyORF-finderwascomparedwithCNAaminoacidsequencesofotherfu- gusdownloadedfrom NCBI.FluorescentquantitativePCR wasusedtodetectrelativeexpressionofvv—CNA atdifferent growthstagesof volvaeea.R【esuhlThecodingregionofVv—CNAwas2503bp,including10introns(intronretention wasdete

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