短丝木犀转录组测序及类萝卜素生物合成相关基因表达分析.PDFVIP

第４０卷　 第５期 南京林业大学学报（自然科学版） Ｖｏｌ．４０，Ｎｏ．５ ２０１６年９月 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｎａｎｊｉｎｇ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ （Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ Ｅｄｉｔｉｏｎ） Ｓｅｐｔ．，２０１６ － ｄｏｉ：１０．３９６９／ ｊ．ｉｓｓｎ．１０００ ２００６．２０１６．０５．００４ 短丝木犀转录组测序及类胡萝 卜素 生物合成相关基因表达分析 １ ２ １ １ 陈　 林 ，李龙娜 ，戴亚平 ，杨国栋 （１． 南方现代林业协同创新中心，南京林业大学生物与环境学院，江苏　 南京　 ２１００３７； ２． 南京农业大学农业生物学虚拟仿真实验教学中心，江苏　 南京　 ２１００９５） 摘要：短丝木犀（Ｏｓｍａｎｔｈｕｓ ｓｅｒｒｕｌａｔｕｓ）是我国特有的木犀属香花树种，具有极高的开发应用前景。 笔者以短丝木 ＴＭ 犀为研究材料，应用Ｉｌｌｕｍｉｎａ ＨＩＳｅｑ ２０００高通量测序平台，对短丝木犀的花和叶芽进行转录组深度测序和拼接 组装，构建和预测了短丝木犀不同组织间的基因表达谱及其代谢通路。 转录组测序共获得１６．９４ Ｇ 的有效数据， 经Ｔｒｉｎｉｔｙ从头组装得到９２７９８条单基因簇（ｕｎｉｇｅｎｅｓ），其中３５ ８５１条ｕｎｉｇｅｎｅｓ 与Ｎｒ、Ｎｔ、Ｐｆａｍ、ＫＯＧ、Ｓｗｉｓｓ⁃Ｐｒｏｔ、 ＫＥＧＧ、ＰＦＡＭ等７ 大公共数据库比对获得了基因功能注释信息。 由ＫＥＧＧ 代谢通路分析发现，共有８ ７７９ 条 ｕｎｉｇｅｎｅｓ参与到２６２个代谢通路中，其中参与到色素和香味代谢的基因分别有５３条和３３５条。 此外，针对６条 在短丝木犀花和叶芽间显著差异表达的参与类胡萝卜素生物合成的相关基因，通过实时荧光定量ＰＣＲ，验证了 它们在不同组织间的表达模式。 关键词：短丝木犀；香花树种；转录组测序；单基因簇；差异表达基因；实时荧光定量ＰＣＲ － － － 中图分类号：Ｓ６８５１３；Ｑ７８１　 　 　 　 　 　 　 文献标志码：Ａ 文章编号：１０００ ２００６（２０１６）０５ ００２１ ０８ Ｄｅ ｎｏｖｏ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃａｒｏｔｅｎｏｉｄｓ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｉｎ Ｏｓｍａｎｔｈｕｓ ｓｅｒｒｕｌａｔｕｓ １ ２ １ １ ＣＨＥＮ Ｌｉｎ ，ＬＩ Ｌｏｎｇｎａ ，ＤＡＩ Ｙａｐｉｎｇ ，ＹＡＮＧ Ｇｕｏｄｏｎｇ （１． Ｃｏ⁃Ｉｎｎｏｖａｔｉｏｎ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｓｕｓｔａｉｎａｂｌｅ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ ｉｎ Ｓｏｕｔｈｅｒｎ Ｃｈｉｎａ，Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｔｈｅ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ， Ｎａｎｊｉｎｇ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｎａｎｊｉｎｇ ２１００３７，Ｃｈｉｎａ；２．Ｖｉｒｔｕａｌ Ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔ Ｔｅａｃｈｉｎｇ Ｃｅｎｔｅｒ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｎａｎ