a physical map for the amborella trichopoda genome sheds light on the evolution of angiosperm genome structure基因组物理图谱的amborella trichopoda揭示了被子植物进化的基因组结构.pdfVIP

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2017-09-05 发布于上海
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a physical map for the amborella trichopoda genome sheds light on the evolution of angiosperm genome structure基因组物理图谱的amborella trichopoda揭示了被子植物进化的基因组结构.pdf

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a physical map for the amborella trichopoda genome sheds light on the evolution of angiosperm genome structure基因组物理图谱的amborella trichopoda揭示了被子植物进化的基因组结构

Zuccolo et al. Genome Biology 2011, 12:R48 /2011/12/5/R48 RESEARCH Open Access A physical map for the Amborella trichopoda genome sheds light on the evolution of angiosperm genome structure 1 2 2 3 1,4 1 Andrea Zuccolo , John E Bowers , James C Estill , Zhiyong Xiong , Meizhong Luo , Aswathy Sebastian , 1 1 1 5 5 2,6,7 José Luis Goicoechea , Kristi Collura , Yeisoo Yu , Yuannian Jiao , Jill Duarte , Haibao Tang , 2 8,9 1 2,7 3 Saravanaraj Ayyampalayam , Steve Rounsley , Dave Kudrna , Andrew H Paterson , J Chris Pires , Andre Chanderbali10, Douglas E Soltis10, Srikar Chamala10, Brad Barbazuk10, Pamela S Soltis11, Victor A Albert12, 5,13 14 15 16 17 5 Hong Ma , Dina Mandoli , Jody Banks , John E Carlson , Jeffrey Tomkins , Claude W dePamphilis , Rod A Wing1 and Jim Leebens-Mack2* Abstract Background: Recent phylogenetic analyses have identified Amborella trichopoda, an understory tree species endemic to the forests of New Caledonia, as sister to a clade including all other known flowering plant species. The Amborella genome is a unique reference for understanding the evolution of angiosperm genomes because it can serve as an outgroup to root comparative analyses. A physical map, BAC end sequences and sample shotgun sequences provide a first view of the 870 Mbp Amborella genome. Results: Analysis of