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毛竹TIPs基因家族成员组织表达模式研究-林业科学研究

林业科学研究 2016,29(4):521 528 ForestResearch   文章编号:10011498(2016)04052108 毛竹 TIPs基因家族成员组织表达模式研究 孙化雨,娄永峰,李利超,赵韩生,高志民 (国际竹藤中心,国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,北京 100102) 摘要:[目的]通过研究毛竹TIPs的分子特征和表达模式,为揭示逆境胁迫条件下 TIPs在竹子中的作用提供证据, 为培育抗逆的植物新品种提供新的基因资源。[方法]以毛竹为对象,利用生物信息学方法对毛竹基因组中的TIPs 基因进行了全面分析,采用实时荧光定量PCR技术分析基因在不同组织及干旱、水淹和NaCl胁迫下的表达模式。 [结果]毛竹基因组中含有6个 TIPs同源基因,分别隶属于3个亚类(TIP1、TIP2和TIP4)。基因结构预测显示, PeTIP1;1、PeTIP1;2、PeTIP2;2和PeTIP4;2由2个外显子和1个内含子组成,而PeTIP2;1和PeTIP4;1由3个外显 子和2个内含子组成。蛋白结构分析显示,毛竹6个TIPs均具有2个典型的NPA结构域和4个ar/R模体。通过 转录组数据分析基因的组织表达特异性,结果表明PeTIP1;1在各组织中的表达丰度均较高;PeTIP1;2主要在花中 表达;PeTIP2;1在根和鞭中表达量较高;PeTIP2;2在根中特异表达;PeTIP4;1在叶片中表达丰度最高;PeTIP4;2在 笋和鞭中表达水平较高,在根中最低。实时定量PCR结果分析证明,干旱处理后毛竹根中PeTIP4;1的表达量显著 升高(p<0.01),PeTIP2;1、PeTIP2;2和PeTIP4;2表达受到抑制(p<0.01);水淹处理后根中PeTIP1;1和PeTIP4;1 表达量显著增加(p<0.01),PeTIP1;2、PeTIP2;2、和PeTIP4;2则显著降低(p<0.01);NaCl处理后根中6个PeTIPs 的表达量均显著增加(p<0.01)。干旱处理后毛竹叶片中PeTIP1;1、PeTIP1;2和PeTIP4;1表达量均显著增加(p< 0.01);水淹处理后叶片中PeTIPs表达量均显著提高(p<0.01);NaCl处理后叶片中PeTIP2;1表达受到明显抑制(p <0.01)。[结论]PeTIPs可能在毛竹抵抗干旱、水淹和NaCl等非生物胁迫中发挥着不同程度的作用。 关键词:毛竹;液泡膜内在水通道蛋白;表达分析 中图分类号:S795.7 文献标识码:A TissueExpressionPatternAnalysisofTIPsGenesinPhyllostachysedulis SUNHuayu,LOUYongfeng,LILichao,ZHAOHansheng,GAOZhimin (InternationalCenterforBambooandRattan,StateForestryAdministrationKeyLaboratoryontheScienceand TechnologyofBambooandRattan,Beijing 100102,China) Abstract:[Objective]Torevealtheroleoftonoplastintrinsicproteins(TIPs)inbamboounderstressconditions andprovidenewgeneticresourceforthebreedingofnewvarieties.[Method]Themolecularcharacteristicsandex pressionprofilesofTIPsinmosobamboo(Phyllostachysedulis(Carr.)H.deLehaie)wereconducted.Thegene expressionindifferenttissuesandthoseunderdrought,waterandNaClabioticstresseswereanalyzedwithrealtime quantitativePCR.[Result]Theresultindicatedth

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