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毛竹TIPs基因家族成员组织表达模式研究-林业科学研究
林业科学研究 2016,29(4):521 528
ForestResearch
文章编号:10011498(2016)04052108
毛竹 TIPs基因家族成员组织表达模式研究
孙化雨,娄永峰,李利超,赵韩生,高志民
(国际竹藤中心,国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,北京 100102)
摘要:[目的]通过研究毛竹TIPs的分子特征和表达模式,为揭示逆境胁迫条件下 TIPs在竹子中的作用提供证据,
为培育抗逆的植物新品种提供新的基因资源。[方法]以毛竹为对象,利用生物信息学方法对毛竹基因组中的TIPs
基因进行了全面分析,采用实时荧光定量PCR技术分析基因在不同组织及干旱、水淹和NaCl胁迫下的表达模式。
[结果]毛竹基因组中含有6个 TIPs同源基因,分别隶属于3个亚类(TIP1、TIP2和TIP4)。基因结构预测显示,
PeTIP1;1、PeTIP1;2、PeTIP2;2和PeTIP4;2由2个外显子和1个内含子组成,而PeTIP2;1和PeTIP4;1由3个外显
子和2个内含子组成。蛋白结构分析显示,毛竹6个TIPs均具有2个典型的NPA结构域和4个ar/R模体。通过
转录组数据分析基因的组织表达特异性,结果表明PeTIP1;1在各组织中的表达丰度均较高;PeTIP1;2主要在花中
表达;PeTIP2;1在根和鞭中表达量较高;PeTIP2;2在根中特异表达;PeTIP4;1在叶片中表达丰度最高;PeTIP4;2在
笋和鞭中表达水平较高,在根中最低。实时定量PCR结果分析证明,干旱处理后毛竹根中PeTIP4;1的表达量显著
升高(p<0.01),PeTIP2;1、PeTIP2;2和PeTIP4;2表达受到抑制(p<0.01);水淹处理后根中PeTIP1;1和PeTIP4;1
表达量显著增加(p<0.01),PeTIP1;2、PeTIP2;2、和PeTIP4;2则显著降低(p<0.01);NaCl处理后根中6个PeTIPs
的表达量均显著增加(p<0.01)。干旱处理后毛竹叶片中PeTIP1;1、PeTIP1;2和PeTIP4;1表达量均显著增加(p<
0.01);水淹处理后叶片中PeTIPs表达量均显著提高(p<0.01);NaCl处理后叶片中PeTIP2;1表达受到明显抑制(p
<0.01)。[结论]PeTIPs可能在毛竹抵抗干旱、水淹和NaCl等非生物胁迫中发挥着不同程度的作用。
关键词:毛竹;液泡膜内在水通道蛋白;表达分析
中图分类号:S795.7 文献标识码:A
TissueExpressionPatternAnalysisofTIPsGenesinPhyllostachysedulis
SUNHuayu,LOUYongfeng,LILichao,ZHAOHansheng,GAOZhimin
(InternationalCenterforBambooandRattan,StateForestryAdministrationKeyLaboratoryontheScienceand
TechnologyofBambooandRattan,Beijing 100102,China)
Abstract:[Objective]Torevealtheroleoftonoplastintrinsicproteins(TIPs)inbamboounderstressconditions
andprovidenewgeneticresourceforthebreedingofnewvarieties.[Method]Themolecularcharacteristicsandex
pressionprofilesofTIPsinmosobamboo(Phyllostachysedulis(Carr.)H.deLehaie)wereconducted.Thegene
expressionindifferenttissuesandthoseunderdrought,waterandNaClabioticstresseswereanalyzedwithrealtime
quantitativePCR.[Result]Theresultindicatedth
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