第11章 微生物的分赖泥.pptVIP

第十一章微物的分类和鉴定; 科学家估计有分类纪录的各类物种大约有150万，其中微生物超过10万种，而且其数目还在不断增加。微生物学工作者要认识、研究和利用微生物或控制有害微生物，必须对它们进行分类（classification）。; 分类学是由三个关系极为密切并交织在一起的要素组成，这三个要素就是分类、命名和鉴定。 分类(classification)是把单位(unit)归纳为群(group)，并严格按顺序加以排列。 命名(nomenclature)是给予在分类中被定义的单位以名称。 鉴定(identification)是把在分类中未知的生物体进行定义并加以命名的过程。;微生物分类学：;二、分类原则;三、分类目的;第二节 进化的测量指征;（一）挑选大分子的原则：;（二）rRNA作为进化指征的理由; 1.rRNA参与生物蛋白质的合成过程，其功能是任何生物都必不可少的，而且在生物进化的漫长历程中，其功能保持不变； 2.在16SrRNA分子中，即含有高度保守的序列区域，又有中度保守和高度变化的序列区域，因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究；; 3.16SrRNA相对分子质量大小适中，便于序列分析； 4.16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中（真核生物中其同源分子是18SrRNA）。 ;（三） rRNA序列测定和分析方法;二、系统发育树;系统树 无根树 有根树 图型中，分枝的末端和分枝的连接点称为结（node），代表生物类群，分枝末端的结代表仍生存的种类。 系统树可能有时间比例，或者用两个结之间的分枝长度变化来表示分子序列的差异数值。 ;三、三界生物的由来; 古细菌（Archaebicteria）、 真细菌（Eubacteria）、真核生物（Eukaryotes）。 1990年，他为了避免把古细菌也看作是细菌的一类，又把三界（域）改称为： Bacteria（细菌）、Archaea(古生菌)和Eukary（真核生物），并构建了三界（域）生物的系统树。;(Olsen和Woese 1993);第三节 细 菌 分 类;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;常用的细菌分类术语; 种（species)：是生物分类中基本的分类单元和分类等级。 伯杰氏 (Bergey) 给种的定义是：“凡是与典型培养菌密切相同的其他培养菌统一起来，区分成为细菌的一个种。”;二. 微生物的命名;例如：金黄色葡萄球菌的学名为： Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 属名：葡萄球菌 种名：金黄色 命名人的姓 命名年份 又如： Peptostreptococcus foetidus （ Veillon ） Smith 属名：消化链球菌 种名：恶臭 原命名者 改名者 变种的学名：枯草芽孢杆菌黑色变种 Bacillus subtilis var. niger 属名：芽孢杆菌 种名：枯草 原命名者 改名者;（二） 命名模式及其指定;（三） 新名称的发表;三、细菌分类和伯杰氏手册;（一）获得细菌的纯培养物 （二）查找权威性的鉴定手册 《伯杰氏细菌学鉴定手册》、《原核生物》、《常见细菌系统鉴定手册》 （三）应用合适的方法确定细菌的分类地位 经典分类方法 分子分类法 血清学试验与噬菌体分型 细菌快速鉴定和自动化分析技术;第四节 微生物分类鉴定的特征和技术;（二）生理生化特征;二、血清学试验与噬菌体分型;（二）噬菌体分型;三、氨基酸的顺序和蛋白质的分析 ;四、核酸的碱基组成和分子杂交; 亲缘关系近的生物,它们应该具有相似的G+C含量。现有数据表明: 高等植物的G+C含量范围大约35%～50%之间； 原核生物中G+C含量变化幅度宽达22%～80%； 脊椎动物G+C含量约35%～45%之间； 这足以表明原核生物是一个极其多样性的类群。 ; 目前,虽然还没有一个统一的界定各级分类单元的G+C含量标准，但大量资料表明： 同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4%～5%以下； 同属不同种的差别在10%～15%，通常底于10%。 所以G+C含量已经作为建立新的微生物分类单元的一项基特征，它对于种、属甚至科的鉴定有重要意义