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桑树低温诱导基因Wap25及其编码的蛋白质的生物信息学分析 摘要分析结果表明等电点pI5.52，分子式为C1045H1673N301O368S4 ，分子量为24469.8Da，摩尔消光系数19940，7-29之间为信号肽区域,功能结构域有三个低复杂性的区域，亚细胞定位于细胞核中，该登录序列为基因组DNA形式，存在跨膜结构域，二级结构以随机卷曲和α-螺旋为主，Bioinformatics Analysis Low-temperature-induced protein Wap25 Gene and Protein in Morus mongolica Abstract: The character of WAP25 gene encoding protein such as the constitution of amino acids,soelectric point, alienation/proximity water area secondary structure in WAP25 were analyzed by a series bioinformatics of software,and then compared with Lophopyrum elongatum and Triticum aestivum.The results show that WAP25 protein of Morus mongolica has 226 amino acids ,total number of atoms is 3391 and extinction coefficient is 34950 , The predicted theoretica pI is 5.52 and the structural formula is C1045H1673N301O368S4 which is 24469.8Da molecular weight. The area of signal peptide is 6-29,Factor I module of WAP25 Protein have three low complexity area , lie in Mitochondria, the nucleic acid sequences of accession in GenBank is genomic DNA, don’t have transmembrane topologieal structure and α-helix and random coil are main component all secondary structures, Analysis the three-dimensional structure of the protein didn’t found the corresponding template. Key word : Morus mongolica ; Wap25 gene ; bioin formatics 低温诱导基因是植物在适应低温胁迫的过程中，体内将会发生一系列生理生化反应，多种基因得以诱导表达，这些基因的表达在时空上是有序发生的，并相互联系形成了低温应答的分子机制[1] 。诱导基因主要为了保护植物细胞免受水分胁迫伤害。在寒冷的冬天具有抗冻性的桑树将会免受伤害。 桑既是蚕茧生产的重要原料，也是传统的药用植物，具有降血糖、血脂和抗肿瘤病毒等多种药理[2] ;木材供雕刻；茎皮纤维好；果生食或酿造；种子含油30％，供油漆等用。本文用生物信息学方法及相应氨基酸序列的理化性质、结构特征、生化功能及系统演化关系等进行预测和分析，以期为深入桑的分子机理提供理论依据。数据来源于NCBI和蛋白质数据库GenBank）中已登录的桑的核酸序列及其对应的氨基酸序列：（Accession：）。使用NPS@蛋白质二级结构预测Wap25基因编码蛋白的理化性质 　 桑树低温诱导蛋白wap25基因编码蛋白的氨基酸序列通过 ORF finder软件分析 ,可得到完整的 ORF位于核苷酸序列的 1-680区域(见图2) 。 用 ProtParam预测桑树低温诱导蛋白WAP25的理化性质 ,推测该蛋白的分子式(Form)1045H1673N301O368S4 ,相对分子质量(Molecular weight)为24469.8KD ;等电点(Theoretical pI)为5.52 ; 总的原子数目为3391;不稳定参数为29.38,属于稳定蛋白. GRAVY（grand average of hydropathicity）值为-1.020表明其为疏水性蛋白; 预测该蛋白为脂溶性.摩尔消光系数20065，半