PCRSSCP法检测非小细胞肺癌中FADD基因突变探究.docVIP

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PCRSSCP法检测非小细胞肺癌中FADD基因突变探究

PCRSSCP法检测非小细胞肺癌中FADD基因突变探究  【摘要】 检测Fas相关死亡结构域蛋白(Fasassociated death domain protEin,FADD)基因在人非小细胞肺癌(nonsmall cell lung cancer,NSCLC)中的突变情况,以探讨该基因在肺癌发生 发展 中的作用及机制。 方法 采用聚合酶链反应-单链构象多态性 分析 (polymerase chain reaction and singlestrand conformation polymorphism, PCRSSCP)检测74例NSCLC原发灶癌组织及13例癌旁正常肺组织中FADD基因突变情况。结果 74例NSCLC组织中检出5例发生FADD基因突变,FADD基因突变与癌的淋巴结转移呈显著正相关(rs=0.378,P=0.001),与其他临床病理特征无关。结论 NSCLC中存在着FADD基因突变。FADD基因突变在NSCLC的发生发展中可能起着重要作用。 【关键词】 肺肿瘤 突变 FADD基因 PCRSSCP   0 引言   肺癌组织中癌细胞凋亡水平受抑是肺癌发生发展的重要机制之一,涉及到一系列凋亡相关基因的改变及异常表达[1,2]。参与调控细胞凋亡的蛋白很多, 研究 证实Fas相关死亡结构域蛋白(Fasassociated death domain protEIn,FADD)是一种具有普遍意义的死亡结构域蛋白,在多种细胞表面死亡受体介导的细胞凋亡过程中起着关键作用[35]。NSCLC中存在着多种凋亡相关基因的突变[6],而有关肺癌组织中FADD基因突变的研究,国内外报道尚为少见。为此,我们 应用 PCRSSCP技术检测FADD基因在NSCLC中的突变情况,以探讨该基因在肺癌发生发展中的作用及机制。   1 资料与方法 论文代写   1.1 标本 62例肺癌组织及13例癌旁正常组织标本取自武汉大学医学院病理教研室存档的1998年1月~2002年7月的组织蜡块,12例新鲜肺癌组织为2002年6月~2003年3月武汉大学人民 医院 胸外科手术切除标本。男性50例,女性24例;年龄43~71岁,中位年龄56岁。按照WHO标准(1999年第3版)进行组织学分类,鳞癌31例,腺癌43例;按国际抗癌联盟(UICC,1997年第5版)TNM分期,T1期17例,T2期17例,T3期21例,T4期19例;N0期31例,N1期25例,N2期18例。 毕业论文   1.2 模板DNA的提取 石蜡包埋组织模板DNA的提取 参考 文献 [7]进行。新鲜肺癌组织DNA抽提,具体方法参见分子克隆酚-氯仿抽提法。   1.3 PCPSSCP银染 我们选取FADD基因的第一外显子区域扩增,其引物序列,见表1。50μl反应体系,含1×PCR缓冲液,1.5mmol/L Mgcl2,0.2mmol/L dNTPs,0.5μmol/L 引物,5μl模板,2u Taq酶;PCR扩增反应条件为:94℃预变性12min;94℃变性30s,50℃~60℃退火30s,72℃延伸30s, 35个循环; 72℃延伸5min。扩增完毕后,取6μl PCR产物于2%琼脂糖凝胶电泳鉴定扩增成功并无非特异性扩增后,再作SSCP。取3~4μl PCR产物,加9μl H2O及1.5μl 10×碱变性液(NaOH 0.5mol/L,EDTA 10mmol/L),37℃孵育10min后加1.5μl变性上样缓冲液(98%去离子甲酰胺、10mmol/L EDTA、0.25%溴酚篮),吸取10μl上样于8%聚丙烯酰胺凝胶(29∶1),同等量100bp DNA Marker作分子量对照。15V/cm电泳10min后,将电泳槽置于冰水浴,12V/cm电泳直至溴酚篮到达凝胶底部。电泳结束后,小心取下凝胶,行银染。与正常对照相比,有异常泳动条带者判断为基因外显子突变。   表1 FADD基因外显子1的PCR引物序列(略) 论文代写   1.4 统计学处理 本组所得数据采用χ2检验和Spearman相关分析,数据统计在SPSS10.0软件上进行,以Plt;0.05为有统计学意义。   2 结果   FADD基因第一外显子在74例NSCLC组织和13例癌旁正常肺组织中均全部扩增成功,见图1;癌组织中FADD基因第一外显子扩增产物有5例出现异常泳动条带(6.8%),而在13例癌旁肺组织扩增产物中未显示异常,见图2。5例检出突变的标本均为有淋巴结转移的肺癌。NSCLC组织中FADD基因突变与肺癌的组织学类型、T分期均无显著相关,但与淋巴结转移呈显著相关,N分期越高者,发生FADD基因突变概率越高,进一步行Spearman相关分

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