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2017-09-11 发布于上海
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a transversal approach to predict gene product networks from ontology-based similarity截线的方法来预测基因产物从基于本体的相似性网络

BMC Bioinformatics BioMed Central Methodology article Open Access A transversal approach to predict gene product networks from ontology-based similarity 1 2,3 1 Julie Chabalier* , Jean Mosser and Anita Burgun Address: 1E.A 3888, Modélisation Conceptuelle des Connaissances Biomédicales, Faculté de Médecine, Université de Rennes 1, IFR 140, 35043 Rennes Cedex, France, 2CNRS UMR 6061 Génétique et Développement, Faculté de Médecine, Université de Rennes 1, IFR 140, 35043 Rennes Cedex, France and 3OUEST-genopole® transcriptomic platform, Faculté de Médecine, Université de Rennes 1, IFR 140, 35043 Rennes, France Email: Julie Chabalier* - julie.chabalier@univ-rennes1.fr; Jean Mosser - jean.mosser@univ-rennes1.fr; Anita Burgun - anita.burgun@univ- rennes1.fr * Corresponding author Published: 2 July 2007 Received: 10 November 2006 Accepted: 2 July 2007 BMC Bioinformatics 2007, 8:235 doi:10.1186/1471-2105-8-235 This article is available from: /1471-2105/8/235 © 2007 Chabalier et al; licensee BioMed Central Ltd. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (/licenses/by/2.0), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited. Abstract Background: Interpretation of transcriptomic data is usually made through a standard approach which consists in clustering the genes according to their expression pattern