植物DNA条形码促进系统发育群落生态学发展-中国森林生物多样性.PDF

生物多样性 2011, 19 (3): 284–294 Doi: 10.3724/SP.J.1003.2011.11250 Biodiversity Science http: // 植物DNA条形码促进系统发育群落生态学发展 1, 3* 2, 3 2 1 裴男才 张金龙 米湘成 葛学军 1 (中国科学院华南植物园, 中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室, 广州 510650) 2 ( 中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室, 北京 100093) 3 (中国科学院研究生院, 北京 100049) 摘要: 系统发育群落生态学是近年兴起的一个重要生态学研究分支, 它以群落生态学为基础并引入了系统发育 的分析方法, 全面动态地反映了群落中物种内和物种间的相互作用关系, 揭示了群落格局形成的生态学过程, 研 究了生物多样性的形成及维持机制。巴拿马BCI (Barro Colorado Island)样地的成功例子说明, 在固定样地进行长 期的群落生态与系统发育研究切实可行且极具意义; DNA条形码的快速兴起对这一研究发挥着重要作用。本文先 列举了群落生态与系统发育综合分析能解决的群落系统发育结构、群落生态位结构、生物地理学和性状进化等 生态学问题; 接着介绍了标准植物DNA条形码以及利用片段组合(rbcL+matK+trnH-psbA)进行快速物种识别和近 缘种区分、精确群落系统发育关系的构建以及群落生态学研究; 随后提出DNA条形码研究在类群水平上需注意 两片段的条形码组合(matK+rbcL)在同属种鉴别能力上的不足, 而在较大尺度群落水平上需对实验设计进行优 化。DNA条形码将为探讨物种多样性及其维持机理、系统发育beta 多样性以及群落水平上功能性状进化研究提 供新的思路。 关键词: 群落系统发育重建, 群落生态学, rbcL, matK, trnH-psbA, 大型固定样地, APG分类系统 Plant DNA barcodes promote the development of phylogenetic commu- nity ecology 1, 3* 2, 3 2 1 Nancai Pei , Jinlong Zhang , Xiangcheng Mi , Xuejun Ge 1 Key Laboratory of Plant Resource Conservation and Sustainable Utilization, South China Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou 510650 2 State Key Laboratory of Vegetation and Environmental Change, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100