应用cpSSR和EST-SSR标记进行柑橘特异种质.PDFVIP

园 艺 学 报 2010 ，37 （3 ）：465 –474 Acta Horticulturae Sinica 应用 cpSSR 和 EST-SSR 标记进行柑橘特异种质 资源遗传背景研究 1,2 2,* 王福生 ，江 东 1 2 （西南大学园艺园林学院，重庆 400715 ； 中国农业科学院柑桔研究所，重庆 400712 ） 摘 要：将叶绿体 SSR 和 EST-SSR 标记用于揭示柑橘及其近缘属的系统发育关系，并阐明保存在重 庆国家果树种质柑橘圃内一些特异种质资源的遗传背景。其中 50 份材料和 44 份材料分别用 cpSSR 和 EST-SSR 分析。22 对 cpSSR 引物产生 146 个多态性条带，平均检测到 6.64 个多态性条带，平均 Shannon’s 多样性指数为 0.32 ；18 对 EST-SSR 引物产生 240 个多态性条带，平均检测到 13.3 个多态性条带，平均 多态信息含量（PIC ）为0.73，平均期望杂合度为 0.78 。根据cpSSR 和 EST-SSR 分析，结合形态学证据， 阐明一些特异柑橘种质资源的遗传背景，同时证明莽山野橘、元橘、宜昌橙有较近的亲缘关系。 关键词：柑橘；cpSSR ；EST-SSR ；遗传背景 中图分类号：S 666 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2010 ）03-0465-10 Studies on Genetic Background of Important Germplasm Resources Among Citrus Based on cpSSR and EST-SSR Marker WANG Fu-sheng1,2 and JIANG Dong2,* 1 2 （College of Horticulture and Landscape Architecture，Southwest University ，Chongqing 400715 ，China；Citrus Research Institute ，Chinese Academy Agricultural Sciences，Chongqing 400712 ，China） Abstract ：Chloroplast simple sequence repeat （cpSSR ）and expressed sequence tag-simple sequence repeat （EST-SSR ）markers were used to reveal Citrus and its related genera phylogenetic relationship and to clarify the genetic background of some unique citrus germplasms conservered in National Citrus Germplasm Repository （Chongqing ）. Fifty and forty-four accessions were used for cpSSR and EST-SSR analysis respectively. Twenty-two pairs of cpSSR specific primers generated 146 bands with an average of 6.64 alleles per locus and an average Shannon’s information index of 0.32 ；Eighteen pairs of EST-SSR primers produced 240 bands with the mean of 13.3 alleles per locus ，the mean polymorphic information content （PIC ）was 0.