真核生物启动子(polII)-和元生物.PDF

和元生物技术（上海）有限公司 OBIO Technology (Shanghai) Co.,Ltd. 杨兴林博士 yxl@ 2015年8月 介绍 杨兴林 2010年毕业于中科院生化细胞所 主要研究方向: 细胞周期, miRNA与前脂肪细胞 分化,蛋白sumo化修饰, 磷酸化蛋白质组, 基因 组编辑 内容及目标 工具和 研究方 基因信 实验方 实验手 常见实 向的确 息查询 案设计 段的选 验方法 定 择 目标: 对生物学研究的整体思路的把握 • 第一部分常用生物信息学资源 • 第二部分过表达载体的设计 • 第三部分Knock-down/out载体的设计 • 第四部分常见的功能学检测手段 生物学基础研究的理论基础 从基因到蛋白的过程 这是一个精密调控的过程!! 中心法则 转录因子 调控 mRNA 调控 调控 调控 真核生物基因表达示意图 RNA+DNA: lncRNA调控DNA转录 RNA+蛋白: RISC, Cas9+gRNA,RNA病毒 DNA RNA 蛋白+DNA: DNA病毒,转录因子调控启动子表达, TALEN,DNA修饰…. 蛋白 蛋白+蛋白: 蛋白相互作用, 复合体,磷酸化 RNA+RNA: Antisense DNA+DNA:三链DNA 生物学功能 RNA+DNA+蛋白: Cas9基因组编辑, DNA-RNA嵌 合病毒 第一部分 常用生物信息学资源 常用的生物信息学资源 • NCBI 综合性生物信息数据库 / • Uniprot 蛋白质的数据库 / • USCS 基因组数据库 / • DAVID 基因功能注释在线工具 • STRING 蛋白质相互作用数据库 / NCBI cDNA查询, 什么是NM号? RefSeq: NCBI Reference Sequence Database A compreh