基于植物成分的蛋白酶激活受体1 拮抗剂的虚拟筛选和实验筛选.PDFVIP

中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 45 卷 第 10 期 2014 年 5 月 ·1427 · 基于植物成分的蛋白酶激活受体 1 拮抗剂的虚拟筛选和实验筛选 1, 2 2 2 2* 2 潘婷婷 ，周植星 ，韩英梅 ，徐为人 ，汤立达 1. 天津医科大学，天津 300070 2. 天津药物研究院 天津市新药设计与发现重点实验室，天津 300193 摘 要：目的 基于植物成分寻找具有蛋白酶激活受体 1 （PAR-1 ）拮抗作用的新结构类别。方法 将 30 个中药成分与 PAR-1 进行分子对接计算，通过评价对接得分、占据空间、氢键等指标进行虚拟筛选。采用体外豚鼠血小板聚集实验进行活性的实 验筛选。结果 虚拟筛选提示隐丹参酮（T30 ）和葛根素肉桂酰酯（T21 ）具有PAR-1 拮抗作用的前景。实验筛选表明 T21、 杨梅素（T5 ）、大黄素（T28 ）、麦角甾苷（T29 ）具有明确的作用。通过深入分析虚拟和实验筛选结果表明，残基 258 和空 腔 III 对活性的影响是决定性的，其他各区在活性调节中，II 区主要是氢键和匹配的要求，IV 和 V 区主要是疏水性匹配性， 氢键结合对于进一步提升活性具有重要意义。结论 基于阳性药的结合模式的发现了 T21，结合理论和实验还发现 T5、T28、 T29 属于一种新的作用模式，为寻找 PAR-1 拮抗剂的结构类别提供了新的方向。 关键词：蛋白酶激活受体 1 拮抗剂；抗血小板聚集；植物成分；虚拟筛选；分子对接 中图分类号：R285.52 文献标志码：A 文章编号：0253 - 2670(2014)10 - 1427 - 07 DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2014.10.014 Virtual and experimental screening of protease activated receptor 1 antagonist in plant ingredients 1, 2 2 2 2 2 PAN Ting-ting , ZHOU Zhi-xing , HAN Ying-mei , XU Wei-ren , TANG Li-da 1. Tianjin Medical University, Tianjin 300070, China 2. Tianjin Key Laboratory of Molecular Design and Drug Discovery, Tianjin Institute of Pharmaceutical Research, Tianjin 300193, China Abstract: Objective To find the new type of structures with protease activated receptor 1 (PAR-1) inhibition from plant ingredients. Methods Thirty ingredients were docked into PAR-1, and then, docking score, occupied space, hydrogen bonding, and other indicators were used for virtual screening. In vitro platelet aggregation experiments in guinea pig were performed to screen the activities of all ingredients. Results Virtual screening suggested that T30 and T21 had the prospects to inhibit PAR-1. Experiment screening showed that T21, T5,