同源相同(IBD)定位在QTL精细定位中的研究进展.pdfVIP

V01．31 第31卷第2期 家畜生态学报 No．2 2010年3月 Acta AnimalisDomastici Mar．2010 Ecologiae 矿。。。‘。‘。‘、 5专题论述9 ～．o．。．。．。一 鲁立刚1，金深逊1，张建英1，张宗庆1，鲁绍雄2’ [摘 要] 综述了近年来发展较快的QTL定位新策略一同源相同(IBD)定位的原理与方法及 其在QTL精细定位中的研究进展。 [关键词]IBD；QTL；精细定位；研究进展 [中图分类号]$811．5 [文献标识码]A [文章编号] 20世纪90年代以来，随着现代生物学技术的 发展和人类基因组高精度序列图谱的顺利完成，越 的置信区间应小于5cM)，即实施QTL精细定位 fine 来越多的分子标记被定位在染色体上，为直接在 (QTL 略。只有对QTL进行更为精细的定位，才能进一 DNA分子水平上研究控制数量性状的基因(QTL) 步对QTL进行克隆和序列分析，揭示出数量性状 和进行QTL定位奠定了基础。迄今为止，QTL定 位虽然取得了可喜的成绩，但尚不能达到位置克隆 遗传的真实面目，并进而实施精确的分子育种(mo— 所需的精度。就目前影响QT乙定位精度的因素而 lecular 言，关键是定位策略。要想进一步将影响目标性状 综述了近年来发展较快的QTL定位新策略——同 源相同(identityby 的QTL定位在一个更小的区间内(即QTL精细定 位)，就必须采用新的QTL定位策略。 精细定位中的研究进展。 目前借助DNA标记技术进行QTL定位的方 1 IBD定位的发展 法主要有两类：一类是候选基因分析(candidate 同源相同(又称为“血缘一致性”或者“同源一致 geneapproach)；另一类是标记一QTL连锁分析 (marker-QTL linkageanalysis)，也称为基因组扫描 协方差时首先提出来的，即：如果两个等位基因能够 (genomescanning)。纵观QTL的定位方法，候选 基因分析虽然快捷高效，但前提是要已知定位基因 追溯到同一个共同祖先的同一个等位基因，那么这 的生物学功能，并且对效应较小的基因实施定位尚 两个等位基因就具有血缘一致性(IBD)。亲属间的 存在困难，而QTL多数是受微效多基因控制的，因 遗传相关实质上是由于它们有相同的基因来源，即 此候选基因分析实际并不让人乐观；而连锁分析不 在一定程度上是同源一致的。 仅需要一个特定的实验设计群体，而且定位的精度 IBD定位最初应用于人类疾病基因的研究，该 cMu。(1方法认为疾病基因间具有同源性。Te 有限，通常所能达到的定位精度为10～20 cM=1000000 等[2]首先考虑到受累(患病)个体间，不仅仅是疾病 bp≈20～30个基因)。目前影响 QTL定位精度的，标记密度等因素已经不再是瓶颈 基因同源，在基因周围的片段也可能