基因组学前沿-方向东-2.pdf

表观遗传学技术与应用 - DNase I mapping 3C 方向东 研究员 中国科学院北京基因组研究所 Xiangdong FANG, M.D., Ph.D. Professor, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100029, China Affiliate Professor, School of Medicine, University of Washington, Seattle, WA 98195, U.S.A. Epigenetics 1939 年 ，发育生物学家Conrad Waddington正式提出了epigenetics 即表观遗传学的概念 ，他指出 ，表观遗传与遗传相对应 ，主要是研究基 因型(genotype)产生表型(phenotype)的过程。 1942年 ，Waddington又将表观遗传学定义为生物学的一个分支 ，研究 “基因与决定表型的基因产物之间的因果关系” (the causal interactions between genes and their products, which bring the phenotype into being” 1975 年 ，Robin Holliday 对表观遗传学提出比较系统的界定 ，即表观 遗传学是研究在没有DNA 序列变化的情况下 ，可以经过有丝分裂和减 数分裂等遗传方式在细胞和个体世代间传递 ，从而引起基因表达或表型 的改变的生命信息，它是不符合传统孟德尔遗传规律的核内遗传。 Waddington CH. Endeavour 1: 18–20 (1942) BIG_Fang X. 2 Goldberg AD, et al. Epigenetics: a landscape takes shape. Cell 128: 635-638 (2007) Genetics vs. Epigenetics GENETICS DNA Code: 64 triplets of nucleotides encode for 20 amino acids and 3 stop codons. EPIGENETICS RNA Code: Non-coding RNA, miRNA, Alternative Splicing CpG Code: DNA Methylation Histone Code: Histone Modifications, Histone Variants Nucleosome Code: Collocation of Nucleosomes HSs Code: Profile of DNase I Hypersensitive Sites Trans Code: Binding and Interaction Profiles of TFs Cis Code: Distributions Colocalizations of Regulatory Motifs Allele Code: Imprinting, same exact gene may act differently depending on whether they are inherited from the paternal or maternal parent …… BIG_Fang X. Bernstein BE, Meissner A,