利用高科技解决癌症难题.PDFVIP

利用高科技解决癌症难题 莱斯大学使用 POWER7 集群技术来定制治疗方案 Jim Utsler 2011 年 12 月 20 日 资深撰稿人 MSP TechMedia 案例信息： 客户：莱斯大学 主校区：休斯顿 业务：高等教育和高级研究 挑战：解决与癌症放射治疗和研究相关的问题 解决方案：接受拨款和 IBM 捐赠的 BlueBioU 系统来加速癌症治疗和研究 硬件：一个由 49 个节点组成的 POWER7 BlueBioU 高性能计算平台 软件：Red Hat Enterprise Linux 正如与癌症对抗的一些患者所证实的那样，治疗往往比疾病感觉还要糟糕。这就是医学研究者和其 他科学人员努力工作以减轻化疗和放射治疗等治疗的副作用的原因。例如，在放射治疗方面，打算 采用调强质子治疗 (IMPT) 等新疗法来减轻对肿瘤周围健康组织的损害。 但是，传统的找出最小损害的最佳做法所用的时间比医师和患者预想的要长。没有任何两个肿瘤是 一样的，必须以不同的方法治疗每个肿瘤，具体疗法取决于肿瘤的大小和位置等因素。这意味着必 须考虑每个患者的具体情况，为正在接受放射治疗的每个患者创建具有最佳治疗方法的模型。 此外，放射治疗可能会引发潜在的继发性癌症。对具体患者评估此类风险有助于确定应使用哪种特 殊形式的治疗方法。但是，当前的剂量计算引擎不支持此类风险评估。 考虑到这一点，莱斯大学打算使用他们自己的可在几种不同系统上运行的算法，以显著提高提供备 用方法和更安全的放射治疗方法的速度。其中一种系统是 BlueBioU，这是一种基于 IBM POWER7 技 术的高性能计算 (HPC) 环境。在其上运行的应用程序已使用 IBM XL C/C++ 和 XL Fortran for Linux* © 版权所有 IBM 公司 2011 商标 利用高科技解决癌症难题 第 1 页，共 5 developerWorks® /developerWorks/cn/ 编译器进行了优化。现在，非常感谢这个用 HPC 和应用程序改进过的研究平台，它们几分钟就可以 生成结果，而之前需要花费数百个小时。该平台使医生能够更快速地访问所需的信息，从而减少放 射治疗的副作用。 降低风险 还有一年时间就到休斯顿莱斯大学的百年校庆了，该大学不仅是高等教育的温床，还是跨多个学科 进行高级研究的温床。这方面的一个证明是，该大学于 2010 年的校庆成立了 BioScience Research Collaborative (BRC)，将其研究人员、教师以及长期医疗合作伙伴派遣到了德州医学中心，与他们共 同进行生物医学研究。 BRC 将来自医学、生物学和物理学等不同领域的科学家聚集在一起，共同研究各种不同的主题， 其中包括蛋白质折叠、人类基因图谱、生物分子行为和人工器官植入建模。正如人们所期望的那 样，BRC 研究人员还深入研究了癌症治疗方法，比如 IMPT。 这为 Pablo Yepes 等科学家提供了施展其才能的舞台，Pablo Yepes 是莱斯大学物理及天文学系的一 名高级教师（研究副教授）。尽管他学习的是粒子物理学（他与 CERN 日内瓦实验室共同进行这方 面的研究），但他最近开始涉足医学物理学的新兴领域。 更具体地说，他和其他物理学家正在研究放射对癌症患者的影响。“我们收到了休斯顿 M.D. Anderson 癌症中心提供的一些资金，打算开发一种快速方法来计算癌症治疗中放射的分布。例如， 如果您将对某个患者采用放射治疗，首先要了解的就是它对患者的影响，” Yepes 说。 这包括射线进入人体的深度和范围等内容。射线进入人体的地方当然会对人体有损害。如果深入照 射到肿瘤后面的健康组织，也会损害这些组织。但是，这些损害是可以减轻的，通过更改治疗中使 用的放射量，或者更改射线进入人体时的角度。 或者，正如 Yepes 和其他人所发现的那样，可采用不同的放射类型。在采用质子放射的情况下，用 户可以更好地控制放射量，帮助确保射线不会照射到癌细胞后面的健康组织。这会将健康组织所受 的损害限制为只有射入点和射线所经过的地方会受到损害。 尽管这一方法具有很高的精确度，但仍有引发继发性癌症的