APOBEC3B基因缺失和ACE基因Alu插入之间关系的研究.pdf

前 言 基 因 的 插 入 / 缺 失 多 态 性 （ insertion/deletion polymorphism, I/D polymorphism ）是一种重要的遗传标记。APOBEC3B 蛋白是抗病毒因子和逆转 座元件抑制因子 APOBEC3 家族的一个重要成员，它的编码基因在部分人群中 全部缺失，并且缺失率在全世界各地区的分布不等，其变化趋势与人类走出非 洲向外扩张（out-of-Africa expansion ）的迁徙路线一致。 Alu 是逆转座子中的一类短散在重复元件，通过大约 6 千 5 百万年的扩增， 占据了人类基因序列的 10%左右，有超过一百万份拷贝。人类血管紧张素转化 酶（angiotensin converting enzyme, ACE ）基因的第 16 个内含子上的 Alu 插入/ 缺失多态性长期以来是基因组学的研究热点，被报道和多种疾病具有相关性。 巧合的是，该 Alu 插入/缺失多态性在不同地区、人群中的分布也呈现出多样性， 变化趋势同样与人类迁徙路线一致。 APOBEC3B 能够高效地抑制 Alu 的逆转座活动，其插入/缺失多态性在全 球分布的变化趋势恰好与 ACE 基因的 Alu 插入/缺失多态性在全球分布的变化 趋势相似，又都与人类迁徙路线一致，两者之间是否有关联呢？本研究通过统 计比较这两种插入/缺失多态性在世界各地区的具体分布，在吉林省选取随机抽 样人群调查它们的基因型分布以及它们之间是否存在对临床健康指标产生影响 的交互作用，结合以往的研究报道，提出了一种阐释两者关系和有关人类遗传 进化的新观点。 中文摘要 APOBEC3B 基因缺失和 ACE 基因 Alu 插入之间关系的研究 基 因 的 插 入 / 缺 失 多 态 性 （ insertion/deletion polymorphism, I/D polymorphism ）是一种重要的遗传标记。 APOBEC3B 蛋白是胞苷脱氨酶 APOBEC3 家族的一个重要成员，能够催化 胞嘧啶脱氨基为尿嘧啶，并因此具有抗逆转录病毒活性。APOBEC3B 同时也是 一种逆转座子抑制剂，能够高效地抑制短散在重复元件 Alu 的逆转座活动。遗 传学研究表明在部分人的第 22 号常染色体上有一段长达 29.5 kb 的基因缺失， 这段缺失正好包含 APOBEC3B 基因的整个编码区，使 APOBEC3B 蛋白不表达。 APOBEC3B 基因在世界不同地区人群中的缺失率（deletion frequency ）差异明 显，其变化趋势正好与人类走出非洲向外扩张（out-of-Africa expansion ）的迁 徙路线一致。 Alu 是一类哺乳类动物特有的逆转座子，长约 300 bp，在大约 6 千 5 百万 年前出现，经过漫长时间的逆转座扩增，占据了人类全部基因序列的 10%左右， 有超过一百万份拷贝，是在内含子中呈高密度分布，被看作是最成功的转座因 子。血管紧张素转化酶（angiotensin converting enzyme, ACE ）是肾素-血管紧张 素（renin–angiotensin system ，RAS ）系统一个关键的酶，通过催化没有活性的 血管紧张素 I 转化为有活性的血管紧张素 II ，促使血管收缩，减少机体对水和 钠离子的排泄，在调节血压和机体水盐代谢方面发挥非常重要的作用。人的ACE 基因位于第 17 号常染色体上，在部分人 ACE 基因的第 16 个内含子上有一个 Alu 元件，而另一部分人没有，构成了 Alu 插入/缺失多态性，有趣的是，该插 入/缺失多态性显著影响 ACE 的表达水平，Alu 缺失意味着更高的 ACE 表达水 平。ACE 基因的 Alu 插入/缺失多态性长期以来是基因组学的研究热点，被报道 和多种疾病相关，并且被认为影响了人类在走出非洲迁徙过程上对气候变化的 适应能力。巧合的是，ACE Alu 插入/缺失多态性在不同地区人群中的分布也呈 现出多样性，变化趋势也与人类迁徙路线一致。 APOBEC3B 能够高效地抑制 Alu 逆转座，而其插入/缺失多态性的全球分 布变化趋势又