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普通小麦祖先种类TaNAC2a基因的鉴定分析和表达-qqecpocom
植物遗传资源学报2014,15(5):1012.1022
JournalofPlantGeneticResources DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.2014.05.014
普通小麦祖先种类 TaNAC2a
基因的鉴定分析和表达模式研究
张凤洁 ,李雪垠 ,高世庆 ,冯变娥 ,刘婷婷 ,唐益苗 ,赵昌平 ,王爱萍
(山西农业大学农学院,太谷 030801;北京杂交小麦工程技术研究中心,北京 100097;西北农林科技大学农学院,陕西杨凌 712100)
摘要 :采用生物信息学方法,利用核酸、蛋 白数据库对普通小麦祖先种乌拉尔图小麦 ( eumurartHL.)和粗 山羊草
(AegilopstauschiiL.)NAC转录因子基因家族进行分析,分别鉴定 出107、126个NAC蛋白家族成员。根据拟南芥、水稻 NAC
基 因家族分类系统,将其分为 15个亚族。通过与抗逆相关基因TaNAC2a进行同源进化树分析。发现5个 TuNAC、6个AetNAC
基 因与其高度同源,对这些基因的蛋白结构域、基因结构、启动子顺式作用元件及组织表达特性进行分析。结果表明。l1个
NAC蛋白具有典型的NAC结构域。进化关系较近的基因具有相似基因结构:启动子区域预测发现其均含有逆境胁迫响应作
用元件。实时荧光定量PCR结果显示,TuNAC、AetNAC基因分别在乌拉尔图小麦和粗山羊草根、胚芽鞘、叶组织中均有表达,
并呈现出明显的组织表达特异性。通过芯片表达数据和逆境胁迫基因表达试验,推测AetNAC2c基因可能参与植物干旱胁迫
响应,AetNAC2b可能参与调控植物的耐旱、耐低温胁迫反应。上述分析结果为普通小麦祖先种基因家族的系统研究。优异候
选功能基因的预测、筛选提供了试验依据。
关键词:乌拉尔图小麦:粗山羊草;NAC;生物信息学;表达特性
BioinformaticAnalysisandExpressionPatternofNAC Transcription
FactorGenesHomologousto I、7ArC2『ainBreadW heatProgenitors
ZHANGFeng-jie’,LIXue—yin’,GAOShi—qing,FENGBian—e,
LIU Ting—ring ,TANG Yi—miao ,ZHAO Chang—ping ,W ANG Ai—ping
(CollegeofAgriculture,ShanxiAgriculturalUniveni~,Taigu030801;BejiingHybridWheatEngineeringand
TechnologyResearchCenter,Beijing100097;CollegeofAgronomy,NorthwestAFUniversity,YanglingShaanxi712100)
Abstract:Inthisstudy,107and126NAC transcriptionfactorfamilymembersinTriticum urartuL.andAe—
gilopstauschiiL.genomewereidentifiedrespectivelybyHMM profilesearch.Theywerefurtherclassified intotwo
groups,consistingof15subgroupsbasedontheclassificationmethodofArabidopsisandrice.Phylogeneticanalysis
revealedthat5TuNAC genesand6AetNAC geneswerefoundtobesimilarinproteinsequencewithTaNAC2a,
whichhadbeenreportedinvolvingintheresponsetodiversestressesinplant.Phyleticevolution,protein domains,
genestructure,c/s—actingelementsinthepromoterregion,and tissue—specificexpressionpattern ofthese11NAC
genes
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