染色体基因和基因组.ppt

基因组学 * * * * * * * * * * * 定义：某一物种的染色体图谱（也就是我们所知的连锁图谱），显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置，而不是在每条染色体上特殊的物理位置。 　　如果同一条染色体上的两个基因相对距离越长，那么他们减数分裂发生重组的概率将越大，共同遗传的概率也就越小。因此可以根据他们后代性状的分离可以判断他们的交换率，也就可以判断他们在遗传图谱上的相对距离。 * * * 重复单位序列最短，只有2～6bp，串联成簇，长度50～100bp，又称为短串联重复序列（Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对。 按孟德尔共显性方式在人群中世代相传。在基因组中平均50kb就有一个重复序列，突变率低（ 0.04%）。 　　⑵在人群中高度多态，其多态信息含量容量超过70%。其多态性表现为正常人群的不同个体某一基因位点重复序列的重复次数可不一样，同一个体的两个同源染色体上重复次数也可以不一样，即微卫星DNA拷贝数在人群中是可变的。 单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs），即指由于单个核苷酸碱基的改变而导致的核酸序列的多态性，一般认为SNP与点突变的区别在于SNP出现频率高于1%。人类基因组中总共有300万个SNP，平均每1000个碱基中就有一个SNP。SNP的分布不均匀，非转录区要多于转录区，大多数位于蛋白的非编码区。SNP是人类基因组中密度最大的遗传标记，发生频率较高，被认为是继微卫星之后的新一代遗传学标记。在医学遗传学、药物遗传学、疾病遗传学、疾病诊断学、以及人类进化等研究领域都有着很高的研究价值和应用前景。 SNP（单核苷酸多态性）：在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中，绝大多数核苷酸序列一致，而只有一个碱基不同的现象。 * * * * (1) 小卫星 (minisatellite DNA) 小卫星重复单位的核心序列为15一65bp 近缘物种和个体间的小卫星核心序列有着一定的同源性，在一定的条件下可以相互杂交。 VNTR示意图 1 2 3 A　　　B　　C 1 2 3 VNTR变异的原理示意图 DNA指纹图谱原理 ①选择在VNTR特异序列上没有酶切位点的限制性内切酶将动物总基因组DNA切成不同长度的片段 ②以VNTR中特异序列作为探针，进行Southern杂交， ③由于不同个体的串联重复序列的数目和位置不同，形成的杂交谱带具有个体的特异性，人们称为DNA指纹图谱 (DNA fingerprinting, DFP) 小卫星DNA 托马斯·杰弗逊 为美利坚合众国第三任总统。同时也是美国独立宣言主要起草人，及美国开国元勋中最具影响力者之一。 由黑人女子海敏斯留下的子孙，几十年来要求杰弗逊家族承认他们是杰弗逊家族的“正统”后代，而杰弗逊家族始终认为这批黑人的后代没事找事在无理取闹。 1998年11月，美国一位病理学方面的退休教授尤金·福斯特在英国的学术刊物《自然》杂志上发表了题为“杰弗逊是黑人女奴最后一个孩子的父亲”的文章。 ⑵微卫星（microsatellite DNA, MS) 又称简单序列重复(simple sequence repeat,SSR) 是高度重复序列，广泛存在于真核生物基因组，重复单位的核心序列为2~6bp。 以微卫星DNA标记两侧特异性序列设计专一引物，通过PCR技术扩增微卫星片段，扩增产物经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，不同个体间因核心序列的重复次数不同而产生DNA多态性。 微卫星遗传标记示意图 A B PCR扩增 凝胶电泳 1 2 3 AA AB　 BB 遗传标记——SNP 单核苷酸多态性 第四节 人类基因组计划 Craig Venter Francis Collins James D. Watson 人类基因组计划 人类基因组计划 * * 常染色质和异染色质： 用碱性染料处理中期染色体，染色体上部分区域着色较深，称为异染色质。 * * * DNA形成三级结构及染色体的意义是为了压缩分子空间 压缩约1万倍 * * * * * * * 40-80%.牛细胞55%，小鼠70%，果蝇，79% 如转运RNA基因和组蛋白基因。 如18s,5.8s,28s及间隔区组成的转录单位在DNA上串联重复5000次。 ALU家族，一种中等重复序列，长300bp,在170bp处有一个ALU的限制性位点，几十万个成员散布在单倍体基因组中，是人类DNA片段的特征标记。6kb * * * * C值和生物结构或组成的复杂性不一致的现象。 C值矛盾 染色体的功能 有丝分裂 减数分裂 染色体畸变