11微生魏惋的分类.ppt

第十一章 微生物的分类和鉴定 第一节 微生物的分类单元 第二节 微生物的命名 第三节 微生物的分类依据和方法 第四节 微生物在生物界的地位 第五节 各大类微生物的分类系统纲要 微生物分类：是按M的亲缘关系相似程度把M归入各分类单元或分类群（taxon），以得到一个反映M进化的自然分类系统，可供鉴定用的检索表以及可给出符合逻辑的名称的命名系统。 任务：分类（classification），鉴定（identification）与命名（namenclature） 步骤：（获得纯培养物后） 1.据形态特征鉴别其属于哪一大类（B，A，Y，M）。 2.据其生理生化特征，生态特征，免疫特征和遗传特征等。借助于检索表或鉴定手册来依次确定是属于哪个目，科，属，种。 3.最后与该种的模式种加以比较并命名。 第一节 微生物的分类单元 微生物的分类单元也是种。 微生物种——是显示高度相似性，亲缘关系极其接近，与其他种有明显差异的一群菌株的总称。 具体分类时，常用一个被指定的，能代表这个种群的模式菌株或典型菌株（type stain）作为该种的模式种来定种。 一、种以上的分类单元 二、种以下的分类单元 目前正式分类单元 非正式分类单元 ㈠亚种（Subspecies,subsp,ssp.）——是种的进一步细分的单元，一般是指在某一个特征上与模式种有明显而稳定差异的菌株。 例：金黄色葡萄球菌的厌氧亚种 Staphylococcus aureas subsp. anaerobius ㈡变种（Variety,var.）（一般认为是亚种的同义词，现不主张使用） 例：蜡状芽孢杆菌的荧光变种 Bacillus cereus var. fluorescens 产黄绿色荧光色素。 ㈢型（form）（曾用作菌株的同义词，现已废除，仅作若干变异型的后缀）。 例：生物变异型（biovar），形态变异型（morphovar），致病变异型（pathovar），噬菌变异型（phagevar）血清变异型（serovar）等。 ㈣菌株（strain），又称品系：一个菌株是指由一单细胞繁衍而来的克隆或无性繁殖系中的一个M或M群体。 ㈣菌株 菌株实为一个物种内遗传多态性的客观反应，几乎是无数的； 菌株强调的是遗传型，因此，一旦菌株发生突变，遗传重组，均应标新菌株名； 菌株与克隆的（即无性繁殖系）的概念相同； 同一种不同株之间，作为分类鉴定的主要性状虽相同，但作为非鉴定用的“小”性状可以有很大差异。（如：生化性状，代谢产物，和产量性状） 菌株的名称都放在学名后面（见后），可随意用字母，符号，编号或混合型等方式自作决定。 一些菌株 ㈤培养物（culture）：是指一定时间一定空间内微生物细胞群或生长物。 ㈥居群（population）（群体、种群、群丛）：是指一定空间中同种个体的组合。每一个物种在自然界中的存在，都有一定空间结构，在其分散的、不连续的居住场所或分布区域内，形成不同的群体单元，这些群体单元称为～。 第二节 微生物的命名 俗名(common name，vernacular name)是通俗的名字，简洁易懂，记忆方便，但它的涵义往往不够确切，且有使用范围和地区性等方面的限制。（区域性） 学名（scientific name）M的科学名称，按照有关M分类的国际委员会拟定的法则命名的。由拉丁词，希腊词或拉丁化的外来词组成。（国际上统一使用） 一、双名法 属名+种的加词+（首次定名人）+现名定名人+定名年份 （必要，用斜体排字） （可省略，均用正体排字） ⑴每一种M的学名由两个拉丁字，希腊字或拉丁化了的其它文字组成； ⑵属名在前，用名词，字首字母大写，种名在后，用形容词，字首字母小写。（种属名需斜体）。 ⑶属名规定了M的主要特征，如形态特征，生理特征或科学家的名字等，种名补充说明M的次要特征，如颜色，形状，用途等。 ⑷附加部分：①命名者的姓：种名之后，一般可省。 ②改名：首次定名（加括号），现定名人，定名年份 ③新种：在学名之后附sp.nov. 例：Methanobacterium espanolae sp.nov.埃斯帕诺拉甲烷杆菌新种。 ⑸种名难以确定时，一般用 sp或 spp表示，其中sp. 表示一种，spp. 表示若干种。 例：Methanobrevibacter sp.一种甲烷杆菌 Methanobrevibacter spp. 若干甲烷杆菌 二、三名法——对亚种的命名 属名+种名subsp.亚种+附加部分 例：Fusbacterium necrophorum subsp.funduliforme 坏死梭杆菌腊肠状亚种。 第三节 微生物的分类依据和方法 M的分类依据：形态