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17 第十和七章RNA的生物合成
1 第十七章 RNA的生物合成 Preface 转 录:在DNA指导下合成 RNA 的过程。 转录单位:RNA链的转录起始和终止点之间(模板DNA)的转录区域。可以为一个基因或多个基因。 动态过程:见动画 RNA转录过程01 Emphasis RNA 聚合酶的特性 启动子和终止子 操纵子 RNA 后加工 Content 转录及调控 RNA转录后加工 RNA复制 RNA生物合成的抑制剂 1、转录及调控 RNA聚合酶 转录过程 启动子和转录因子 终止子和终止因子 转录过程的调节控制 (1)RNA聚合酶 附1: E. coli 的 RNA 聚合酶组成 附2:真核 RNA聚合酶 (2)转录过程-起始 (2)转录过程-延伸 (2)转录过程-终止 (3)启动子和转录因子 启动子和转录因子:RNA聚合酶能够识别、结合和开始转录的一段DNA片段(弱),转录时需要的辅助因子(PN)为转录因子。 启动子的位置:上游或基因内 正链和负链,上游和下游 附:RNA polymerase binding to Promotor 占据DNA上 75-80bp,即由启动子-55 bp ~+20bp 动态:见 RNA聚合酶与DNA结合 附:原核细胞启动子的组成 大肠杆菌 Pribnow box(框):大肠杆菌转录起点上游(-10序列,TATA box)6bp 保守序列 T90A95T45A60A50T96。其突变不会影响 RNA酶 与 启动子 的结合速度,但会降低双链的解开速度。 识别区域 -35 序列:T85T83G81A61C69A52,突变会影响RNA酶与启动子的结合速度。 附:真核细胞启动子的组成-I 较原核细胞复杂且长,差异大,由转录因子识别。可分为三类分别由RNA聚合酶I、II和III转录),通常第一个核苷酸为A。 类型II启动子:编码 mRNA 基本启动子: 起始子: 上游元件: 应答元件: 附:真核细胞启动子的组成-II 基本启动子:basal promotor Goldberg-Hogness box (TATA盒),-25 ~ -30 左右处7bp 碱基频率:T82 A97 T85 A63/T37 A82 A60/T37 和通用因子(GIF)组成转录的必要元件,非充分条件 和通用因子(GIF)成形成前起始复合物的主要装配位点 影响转录起始频率 附:真核细胞启动子的组成-III 起始子:initiator 共有序列: Py Py A N T/A P y Py 附:真核细胞启动子的组成-IV 上游元件:upstream element, 转录辅助因子 CAAT box(-75序列): 9bp,GGT/CCAATCT, 与RNA酶的结合有关 GC box:CAAT框上游处,GGGCGG,与CAAT框全称为上游因子(upstream elements) 八聚体 octamer:ATGCAAAT (4)终止子和终止因子 终止子:提供转录停止信号的DNA序列 终止因子:协助RNA聚合酶识别终止信号的辅助因子PN 通读和抗终止因子:终止子被特异的因子所阻止,使RNA聚合酶趆过终止子继续转录(read through);引起抗终止作用的PN--抗终止因子。 回顾:见 动画 RNA转录过程02 终止子的识别与特点: 真核生物机制不详 RNA聚合酶和辅助因子本身可识别终止子; 终止子位于已转录DNA序列中(聚合酶只能感受已转录的DNA 在终止信号前均有一个回文序列,产生的RNA可形成由茎环构成的发夹结构,可使聚合酶移动减缓或暂停RNA的合成; 终止子识别的辅助因子:Nus 因子,69kD酸性多肽 注:RNA产生的发夹型结构较多,但只有终止序列可能使转录停止。 附:终止因子ρ (5)转录过程的调节控制 转录调节控制是基因表达最重要的调控途径? 主要方式:时序调控和适应性调控 调节过程:转录起始和终止阶段 Operon structural model: Monod Jacob(France),操纵子:原核生物功能相关的基因的组合,是基因表达和调控的单位:控制部位(启动子+操纵基因)和结构基因 操纵基因:上、下游各有一个相似的回文结构序列 动态过程:见动画 操纵子模型 真核生物与原核生物转录水平的差异 不组成操纵子 存在大量顺式元件和反式因子,调节复杂 以正调节为主,可诱导因子以共价修饰为主(磷酸化) 具有染色质结构水平调节网络 了 解: 正调控,负调控,葡萄糖效应,乳糖操纵子、多(单)顺反子 顺式元件:调节子,操纵子,增强子、衰减子、沉默子 反式作用因子: CRP、 HTH、Zinc finger、HLP、ZIP 2、RNA转录后加工 附:mRNA 与 DNA 的区别 (1)原核生物中RNA后加工 (2)真核生物
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