甲酸分子的结构和性质的计算实验报告.docxVIP

甲酸分子的结构和性质的计算1.实验目的(1)掌握量子化学计算软件Gaussian和GaussView的入门使用方法。(2)学习用量子化学计算方法研究分子结构和性质的基本过程。2.实验原理随着计算机技术及理论化学计算方法的迅速发展，计算化学已成为化学研究领域的一种新的研究手段。化学学科不再是单纯的实验学科，实验与理论计算研究已成为化学学科的两个并行的研究领域。理论计算结果可以与化学实验结果互相比较和印证，前者还能在原子分子的水平上对化学性质、化学反应及其规律进行合理解释或预测。Gaussian程序是目前应用最厂泛的量子化学计算软件。其功能强大，主要采用量子力学计算方法，如从头算、密度泛函理论及半经验等方法，计算分子的能量、几何结构、电子结构、化学热力学和动力学参数、光谱性质、激发态性质以及晶体体系等。GaussView程序是辅助Gaussian程序使用的图形界面软件。对于一般的体系，进行其分子几何结构、电子结构和性质计算的基本步骤为：(1)依据化学理论或文献数据构建合理的分子初始构型(初始几何猜测)。(2)查阅文献，初步选定量子力学计算方法和基组。试做单点能计算。根据计算机性能，确定计算方法和基组。(3)儿何构型优化计算。在每次单点计算中，按照分子总能量对坐标的一阶导数确定毎个原子的坐标移动方向及大小，通过此步骤的多次重复，找到分子势能面上的极小点，既为分子的平衡几何构型，也称为优化构型(4)振动频率计算。在优化构型的基础上，计算分子总能量对坐标的二阶导数，并得到分子各简振模式的振动力常数和频率。N原子分子在稳定的能态下应有3N-5(线型分子)或3N-6(非线型分子)个振动实频(力常数为正)而无虚频(力常数为负)；化学反应过渡态应有且仅有一个虚频。(5)在优化得到的几何构型下，计算分子的电荷分布、轨道、键级等电子结构信息，以及分子的若干物理化学性质。3.实验所需软件和仪器Gaussian03 W软件，Gauss View5.0软件，PC计算机。4.实验步骤(1)构建甲烷分子初始构型。在Gauss View的图形界面上绘制甲烷分子。将文件保存为*.gif格式的G09W输入文件。(2)单点能试算。启动G03W程序，用HF/3-21G命令试算分子的单点能。运行结束后用Gauss View或文本编辑软件打开相应的*. out格式文件，熟悉G09W输出文件的格式和内容。(3)构建甲酸分子初始构型。在Gauss View的图形界面上绘制甲酸分子。将文件保存为*.gif格式的G09W输入文件。(4)几何构型优化和振动频率计算。采用B3 LYP/6-31G Opt Freq命令，对甲酸依次进行几何优化和振动频率计算。若频率分析结果无虚频出现，则确认其为分子的稳定构型。(5)查看输出信息。用Gauss View査看甲酸分子输出综合信息，几何结构、红外吸收光谱以及分子各简振模式的动画演示，打开* . fchk格式的检査点文件可浏览全部分子轨道的三维图形、电荷分布、偶极矩。5.数据记录与处理记录计算所用的量子力学方法和基组；Calculation Type=FREQCalculation Method=RB3LYPBasis Set=6-31G画出甲酸分子的优化几何构型，并记录分子对称性、电子态和结构参数(记录键长、键角和二面角)；This molecule is an asymmetric top. Rotational symmetry number 1.对称性：Cs点群记录分子总能量，每个原子上的净电荷，分子的偶极矩；E(RB+HF-LYP) = -189a.u.Dipole Moment = 1.4173 Debye画出前线轨道图形及分子能级图；7: C1-H2、O4-H5形成σ键成键轨道，O3的两个孤对电子的轨道也参与了分子轨道的形成。9: O3-C1-O4形成离域π键成键轨道。12: C1-O3形成反键轨道，O4-H5形成成键轨道。13: O3-C1-O4形成大π键的反键轨道（其中每个原子的p轨道的波相都完全相反）。记录振动的红外吸收能量，描述振动模式特征，根据采用的理论计算方法选用适当的校正因子(例如B3 LYP泛函一般为0.94-0.96)进行理论振动频率校正；σ/cm-1振动化学键振动形式理论振动频率校正509O4-H5面外弯曲振动γ4841024C1-O4-H5面内弯曲振动δ9731091C1-O4伸缩振动1-O3伸缩振动1-H2伸缩振动4-H5伸缩振动ν3452记录热力学函数(U H G S)的理论预测值，验证热力学参数之间的关系。Zero-point correction= 0.032772 (