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2007年交叉预研基金指南 1、蛋白质组学的生物信息学研究 运用蛋白质组学、生物医学、信息科学和分析化学的原理和方法，对于恶性肿瘤发生的分子机理进行深入探索，解决当今高通量蛋白质组学研究中重要蛋白质获取及翻译后修饰状态鉴定的技术难题，创立蛋白质组学生物信息学分析新方法，提出蛋白质分子分型的新概念、新理论，建立从蛋白质结构模拟、功能分析到药物设计的创新型技术平台。主要研究内容包括：（1）以先进的蛋白质定量定性分析技术研究不同表型的恶性肿瘤之间的差异表达蛋白质组学，完善、发展相关生物信息学算法，快速、准确鉴定差异表达蛋白质，找出作用关键节点，构建蛋白质相互作用网络；（2）开发蛋白质质谱图像分析软件，高通量、自动化识别蛋白质氨基酸的修饰状态，全面、动态地比较不同表型恶性肿瘤蛋白质磷酸化、乙酰化等修饰组学改变，并通过蛋白质分子的空间结构模拟，预测关键氨基酸修饰状态改变对蛋白质空间结构、功能的影响；（3）针对有重要功能的蛋白质，生物信息学预测其有重要功能的结构域，并设计小分子化合物，实现特异、高效干预；（4）生物学实验验证生物信息学分析结果，建立恶性肿瘤早期诊断、生物治疗的实用新方法。 2、膜受体蛋白 细胞膜受体对于细胞的功能具有特殊重要的意义。传统生物学、基因组学和蛋白组研究中发现了许多功能相关的膜受体蛋白，但要在细胞生理学水平理解这些蛋白质的效应和调节，必须对这些膜蛋白质、、分子基础深入