教案山西师大郜刚生物信息学-18-2-蛋白质结构三级预测.pptVIP

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2018-01-14 发布于湖北
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教案山西师大郜刚生物信息学-18-2-蛋白质结构三级预测.ppt

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FIG. 7. Web-Lab Viewer representation of the docking of C18-stearic acid to the hydrophobic cavities of nsLTP1 and nsLTP2 The residues covering the hydrophobic cavities (labeled in A) are removed in B to allow the fatty acid orientation to be visualized clearly. Various residues constituting the hydrophobic cavities are labeled. The fatty acid is positioned compactly in the tunnel-like hydrophobic cavity of nsLTP1, and in the case of nsLTP2 the flexible triangular hollow box accommodates the fatty acid. CaM结合位点的比较可以做 FIG. 9. Comparison of basic residue distribution of nsLTP2 with several known plant defense peptides. A, antifungal protein from poke weed (PDB code 1dkc); B, antifungal protein from radish (PDB code 1ayj); C, thionin from wheat (PDB code 1gps); D, NsLTP2. Panels I and II differ by a 180° rotation of theviewing angle. 碱性残基的比较可以做，分子表面阳电残基的分布是抗病原物的一个特征，这一点已经被证明 I II A B C D 通过结构的模拟，功能的预测和实验的证据（上调表达的诱导性和钙离子积累的同步性），我们得出以下结论： nsLTP家族在马铃薯防御青枯菌的过程中，可能是参与钙离子信号途径发挥其抗病作用的 From structural simulation，functional predication and experimental evidence, A conclusion was drew that 所以我们的图需要有：家族内结构的比较，家族外结构的比较，阳性残基表面示意图，CaM结合位点的示意图，进化？？ 2008 ggniche2008 在排队里边你可以看到当前有哪些人在申请工作，但是你的结果只有你能够看到，也就是只有点击前面的ID号，然后通过密码输入才能看见结果。这里的服务速度实在是太慢了， 3D-JIGSAW Thank you for trying this version of 3D-JIGSAWYour job has been put into a queue. We will e-mail you the results as soon as possibleIf you dont receive them, probably the e-mail address was wrong :-?(Your job-ref is 38dc54a0Comments are appreciated.Email gaogan126.com Protein name potato_a7 SequenceMEMFGKIACFVLLCMVVVAPHAEALSCGQV... Mode automatic 3D-JIGSAW，界面友好，服务快捷 ESyPred3D的使用流程 ESyPred3D - ESyPred3D is a new automated homology modeling program. The method gets using neural networks. by combining, weighting and screening the results of several multiple alignment programs. The final three dimensional