管理生物化学第5章蛋白质的三维结构.pptVIP

脂锚定蛋白与脂连接的4种方式 a.N-豆蔻酰化 b.S-脂肪酰化 c.硫醚异戊二烯化 d.通过酰胺键与糖基磷酯酰肌醇上的乙醇胺连接 硫醚异戊二烯化 膜内在蛋白加脂锚钩 N-豆蔻酰化 S-棕榈酰化 九、蛋白质折叠 蛋白质的变性Ⅰ 蛋白质变性的实质是分子中的次级键被破坏，引起天然构象发生重大变化，但一级结构保持不变。蛋白质变性过程中，往往发生下列现象： 1．生物活性丧失：催化活性、运输功能、运动功 能、与其它物质结合的功能等丧失。 2．一些侧链基团暴露：结构变得松散。 3．一些物理化学性质改变：聚集、沉淀、粘度增 加、旋光及紫外吸收改变。 4．生物化学性质改变：易受蛋白酶水解。 蛋白质的变性Ⅱ 变性剂（denaturing agent）尿素和盐酸胍能与主链竞争形成氢键，破坏蛋白质的二级结构。还能增加疏水基团在水中的溶解度，破坏蛋白质的三级结构。 SDS（十二烷基硫酸钠）也是蛋白质的变性剂，它也是破坏蛋白质分子内的疏水作用。 有些蛋白质变性是可逆的，当变性因素消除后，肽链可自动折叠到天然构象，恢复功能。但也有一些蛋白质难以恢复天然构象，可能是复性（renaturation）所需的条件不具备所致。 核糖核酸酶的变性与复性 蛋白质的折叠 肽链在折叠成蛋白质天然构象的过程中能量降低。 体内蛋白质折叠有酶和分子伴侣（molecular chaperone）协助。协助蛋白质折叠的酶有蛋白质二硫键异构酶，肽基脯氨酰异构酶；分子伴侣起初是作为热休克蛋白（heat shock protein）而发现的,它们协助蛋白质折叠的机理还不清楚。 十、亚基缔合和四级结构(有关四级结构的一些概念) 亚基（isomer）：一般是一条肽链，折叠成球状，若干个亚基通过非共价键聚集成一个多亚基蛋白质，这种蛋白质叫寡聚蛋白质或多聚蛋白质，由两个亚基组成的蛋白质称为二聚体蛋白质，由四个亚基组成的蛋白质称为四聚体蛋白质。有些多聚蛋白质只由一种亚基组成，称为同多聚蛋白质；有些由两种以上的亚基组成，称为杂多聚蛋白质。 单体和原体 亚基有时也称为单体（monomer），对于杂多聚蛋白质来说，不同种类的一套亚基组成一个不对称结构，称为原体（protomer），若干个原体再组成对称的多聚蛋白质。对于同多聚蛋白质来说，一个单体也就是一个原体。杂多聚蛋白质如血红蛋白，由4个亚基组成，两个α亚基，两个β亚基。其中αβ就是一个原体，一共两个原体。 四级缔合的驱动力 主要是疏水作用使亚基缔合在一起，还有极性基团之间的作用。极性基团之间的作用决定亚基间缔合的专一性。虽说亚基间的缔合是非共价键，但也有很多亚基间有共价键交联的情况，主要是亚基间形成二硫键，形成二硫键可以增加亚基间的稳定性。 亚基相互作用的方式Ⅰ 假设的单体 C2对称 C3对称 亚基相互作用的方式Ⅱ C4对称 D2对称 D3对称 对称的类型 当一个物体有这样一个轴，绕轴旋转一定角度（小于360°）可以恢复原样，这个轴就是它的对称轴。这个最小的、可以恢复原样的角度α称为基转角，2π/α= n，n是物体绕轴一圈时与原物体重合的次数，这个物体就是Cn对称（n重环状对称）。 如果一个物体含有一个Cn对称轴，并且在一个垂直于该旋转轴的平面内存在着n个与该轴相交的C2轴，则称这个物体具有二面体对称，用Dn表示。 除了以轴线为对称元素外，还有螺旋对称，即旋转一定角度再加上轴向平移一段距离。 亚基相互作用的方式Ⅲ 四面体对称 八面体对称 亚基相互作用的方式Ⅳ 螺旋对称 二十面体对称 亚基相互作用的方式Ⅴ 前清蛋白二聚体 亚基相互作用的方式Ⅵ 微管蛋白缔合成微管 人免疫缺陷病毒的结构 烟草花叶病毒衣壳蛋白的螺旋对称 四级结构的对称性 由于多肽链的所有α碳是不对称的，并且多肽链几乎总是折叠成不对称或低对称的结构，因此单体蛋白质和亚基都是手性分子，而大多数寡聚蛋白质的亚基排列是对称的。对称性是四级结构蛋白质最重要的性质之一。 四级缔合在结构和功能上的优越性 增强稳定性：比表面积减小，减少了与水的相互作用。 提高遗传经济性和效率：用较少的遗传物质产生较多的蛋白质。 使催化基团汇集在一起：有些酶的催化基团位于不同的亚基上，形成寡聚体后，这些基团汇集到一起，形成活性中