五个湖泊中华刺鳅mastacembelussinensis种群线粒体-湖泊科学.pdfVIP

Ｊ． Ｌａｋｅ Ｓｃｉ．（湖泊科学），２０１６，２８（５）：１０３１⁃１０３８ ＤＯＩ １０１８３０７／ ©２０１６ ｂｙ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｌａｋｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ 五个湖泊中华刺鳅（Ｍａｓｔａｃｅｍｂｅｌｕｓ ｓｉｎｅｎｓｉｓ）种群线粒体细胞色 素ｂ遗传多样性分析∗ 赵子明，叶建生，刘美剑，沈冬冬，黄世熠 （江苏农牧科技职业学院，泰州 ２２５３００） 摘　 要：采用特异性引物对中华刺鳅基因组ＤＮＡ进行扩增和测序，获得了江苏省５个湖泊的中华刺鳅种群线粒体ｃｙｔ ｂ ＋ ＋ 基因７６７ｂｐ 的序列．分析表明，ｃｙｔ ｂ基因中Ａ Ｔ含量略高于Ｇ Ｃ含量，１４４个中华刺鳅共获得ｃｙｔ ｂ基因单倍型２８个，变 异位点３８个，其中单倍型Ｈａｐ１分布最为广泛，可能为祖先型单倍型． 平均单倍型多样性和平均核苷酸多样性指数分别 为０．５８７５１和０．００２１４，遗传多样性较低． 群体间遗传分化系数为０．０３５６，绝大多数的遗传变异都来自群体内部，而群体间 的遗传分化极小． 构建的系统进化树未出现明显的以单个湖泊群体的聚簇，５个湖泊的种群间基因交流极其强烈． 研究结 果表明，当前５个湖泊的中华刺鳅遗传多样性水平比较低，亟待加强保护． 关键词：中华刺鳅；线粒体ＤＮＡ；ｃｙｔ ｂ；遗传多样性；淡水湖 Ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｓｐｉｎｙ ｅｅｌ （Ｍａｓｔａｃｅｍｂｅｌｕｓ ｓｉｎｅｎｓｉｓ） ｆｒｏｍ ｆｉｖｅ ｌａｋｅｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ Ｍｉｔｏ⁃ ｃｈｏｎｄｒｉａｌ ＤＮＡ ｃｙｔ ｂ ｇｅｎｅ ＺＨＡＯＺｉｍｉｎｇ，ＹＥ Ｊｉａｎｓｈｅｎｇ，ＬＩＵ Ｍｅｉｊｉａｎ，ＳＨＥＮ Ｄｏｎｇｄｏｎｇ ＆ＨＵＡＮＧ Ｓｈｉｙｉ （ＪｉａｎｇｓｕＡｇｒｉ⁃ａｎｉｍａｌＨｕｓｂａｎｄｒｙ Ｖｏｃａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｌｌｅｇｅ，Ｔａｉｚｈｏｕ２２５３００，Ｐ．Ｒ．Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｈｅ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ ＤＮＡ ｃｙｔ ｂ ｇｅｎｅ （７６７ ｂｐ） ｏｆ ｓｐｉｎｙ ｅｅｌ ｆｒｏｍ ｆｉｖｅ ｌａｋｅｓ ｉｎ Ｊｉａｎｇｓｕ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ ｗａｓ ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ａｎｄ ｓｅ⁃ ＋ ＋ ｑｕｅｎｃｅｄ． Ｔｈｅ ａｖｅｒａｇｅ ｃｏｎｔｅｎｔｓ ｏｆ Ａ Ｔｗｅｒｅａｌｉｔｔｌｅｈｉｇｈｅｒｔｈａｎｔｈｏｓｅｏｆ Ｇ Ｃｗｈｅｎ３８ｖａｒｉａｂｌｅ ｓｉｔｅｓｗｅｒｅｄｅｔｅｃｔｅｄ，ａｎｄ２８ｈａｐｌｏ⁃ ｔｙｐｅｓｗｅｒｅｒｅｃｏｖｅｒｅｄ．Ｔｈｅａｖｅｒａｇｅｈａｐｌｏｔｙｐｅｄｉｖｅｒｓｉｔｙ （０．５８７５１）ａｎｄｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｄｉｖｅｒｓｉｔｙ （０．００２１４）ｄｅｍｏｎｓｔｒａｔｅｄｖｅｒｙｌｏｗ ｇｅｎｅｔ⁃ ｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｔｈｅ ｓｐｉｎｙ ｅｅｌ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅｆｉｖｅ ｌａｋｅｓ． Ｔｈｅｆｉｘａｔｉｏｎ ｉｎｄｉｃｅ ｏｆ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｖａｒｉａｎｃｅ ｗａｓ０．０３５６，ｗｈｉｃｈ ｓｈｏｗｅｄ ｎｏ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅ ａｍｏｎｇ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ． Ｔｈｅ ＵＰＧＭＡ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅ ｏｆ ｃｙｔ ｂ ｇｅｎｅ ｂｕｉｌｔ ｗｉｔｈ ＭＥＧＡ６．０ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｆｉｖｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓｗｅｒｅ ｎｏｔ ｃｌｕｓｔｅｒｅｄ ｉｎｔｏ ｃｌａｄｅｓｂａｓｅｄ ｏｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｓｔａｎｃｅ． Ｔｈｅｒｅ ｗａｓ ａｎ ｅｘｔｅｎｓｉｖｅ ｇｅｎｅｒａｌ ｆｌｏｗ ａｍｏｎｇ ｓｐｉｎｙ ｅｅｌ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓｆｒｏｍ ｔｈｅｆｉｖｅ ｌａｋｅｓ ｉｎ Ｊｉａｎｇｓｕ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ． Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｓｐｉｎｙ ｅｅｌ ｆｒｏｍｔｈｅｆｉｖｅｌａｋｅｓｈａｄ ｌｏｗ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎｄ ｇｅｎｅｔｉｃａｌｌｙ ｈｏｍｏｇｅｎｅｏｕｓ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，ｉｎｄｉｃａｔｉｎｇ ｔｈｅｉｒ ｗｅａｋ ｖｉａｂｉｌｉｔｙ ｔｏ ｍａｉｎｔａｉｎ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ． Ｔｈｅ ｓｐｉｎｙ ｅｅｌ ｎｅｅｄ ｔｏ ｂｅｗｅｌｌ ｐｒｏｔｅｃｔｅｄ． Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：Ｍａｓｔａｃｅｍｂｅｌｕｓ ｓｉｎｅｎｓｉｓ；Ｍｉｔ