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荧光定量PCR检测志贺菌方法的建立
高春燕 高庆双 刘树平 许林骥 王晶晶 郑建霞
(河北省唐山市妇幼保健院 检验科 063000 河北 唐山)
注:高春燕为本刊通讯员
摘要:目的 建立一种检测志贺菌属快速敏感的荧光定量PCR方法。方法 根据志贺菌属侵袭性质粒抗原H ( invasive p lasmid, ipaH)编码基因序列,设计1对PCR引物特异性靶基因片段,通过检测3株志贺菌属菌株和9株非志贺菌属菌株来评价该方法的特异性;对福氏志贺菌菌液做一系列10倍稀释后进行荧光定量PCR分析敏感性,PCR扩增产物经电泳和测序鉴定。结果 3株志贺菌属菌株出现特定大小的目的条带,9株非志贺菌属菌株未出现目的条带;测序也证实了PCR产物的特异性;荧光定量PCR检测福氏志贺菌ipaH基因的下限为200拷贝/ ml。结论 本研究建立的方法快速、特异、敏感。
关键词 荧光定量PCR;志贺菌属;ipaH
Establishment and application of fluorescence quantitative PCR for detection of Shigella
Gao Chun-yan, Gao qing-shuang, Liu Shu-ping,XU Lin-ji,Wang Jing-jing ZhengJian-xia
(Tangshan Municipal Maternal and Child Care Hospital,Tangshan 063000,Hebei,P.R.China)
Abstract: Objective To establish a testing shigella is rapid sensitive fluorescence quantitative polymerase chain reaction (PCR). Methods: According to shigella belong to invade plasmid antigen H (invasive p lasmid, ipaH) coding gene sequence, design an PCR primers specific target gene fragment, by detecting 3 strains of shigella strains and 9 strains not shigella strains of this method to evaluate the specificity, For mans shigella bacteria liquid do a series of ten times dilution after fluorescence quantitative PCR analysis sensitivity, PCR amplification products by electrophoresis and sequencing appraisal. Results: 3 strains of shigella strains in the size of the specific purpose banding, 9 strains not shigella strains of does not appear purpose banding; Sequencing also confirmed the specificity of the PCR products; Fluorescence quantitative PCR detections shigella ipaH gene lower limit for 200 copies/ml. Conclusion:The established method is rapid, specific and sensitive.
Key words Fluorescence quantitative PCR; Shigella;ipaH
志贺菌是引起细菌性痢疾的常见致病菌,,
1 材料和方法
1.1 仪器和试剂 PE7700PCR扩增仪(美国PE公司);水平式电泳仪(北京东方仪器厂); GDS7600凝胶扫描系统(DF-23B)(英国UVP公司);台式高速离心机(TGL-16G)和水平离心机(上海安亭科学仪器厂);主要试剂为PCR试剂(北京索奥公司产品);DNA分子标准100bp DNA Ladder(大连宝生物公司);DNA提取试剂和Taq酶系(北京索奥公司产品);dNTPs(上海生物工程公司产品);引物和探针(北京索奥生物有限公司合成)。
1.2 实验菌株 鲍氏志贺菌(为卫生部质控菌株)、福氏志贺菌、宋内志贺菌;
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