水稻重要农艺性状自然变异研究进展及其应用策略-生物通.pdfVIP

2015 年 第 60 卷 第 12 期： 1066 ~ 1078 《中国科学》杂志社 专题: 2014年度国家自然科学奖 评 述 SCIENCE CHINA PRESS 水稻重要农艺性状自然变异研究进展及其应用策略 张林, 何祖华* 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所, 植物分子遗传国家重点实验室, 上海 200032 * 联系人, E-mail: zhhe@ 2015-01-28 收稿, 2015-02-10 接受, 2015-03-06 网络版发表 国家自然科学基金资助 摘要 水稻在长期的自然进化和人工选择过程中积累了大量自然变异, 这些自然变异是许多重要 关键词 农艺性状的遗传基础, 也是水稻育种筛选的主要目标. 近些年, 随着分子技术的发展, 水稻自然 水稻 变异研究取得了一系列重要突破. 本文结合最新研究进展, 系统介绍了水稻自然变异的特点及相 自然变异 应分析方法, 并强调了高通量测序技术在今后水稻自然变异挖掘中的意义; 对最近10年来报道的 数量性状 分子机制 抽穗期、产量元件及抗逆和驯化相关性状自然变异的分子机制及驯化特征进行了详细说明; 结合 育种 这些自然变异的分子特征, 总结了利用不同变异类型改良现有品种的方法, 为今后分子育种提供 理论依据. 水稻(Oryza sativa L.)是亚洲及部分非洲国家的 艺性状的遗传规律有了较全面认识, 但阐明这些 主要粮食作物, 而人口问题也是这些国家的主要问 QTL 的分子机制才能更有效地利用这些位点. 目前, 题. 尽管绿色革命基因sd1大大增加了水稻产量, 但 水稻多个重要农艺性状QTL 已经被成功克隆, 包括 随着人口增加, 这种效益将被逐渐吞噬, 未来的粮食 抽穗期、种子大小、穗粒数等, 相应基因的分子机制 需求对水稻育种提出了更高要求[1]. 水稻种质资源丰 也逐渐解析清楚, 从而使对这些性状进行分子改造 富, 拥有很多地方品种及野生种质, 由于特定生长环 成为可能. 另外, 作为单子叶植物研究的模式植物, 境和选择历史, 这些种质中包含许多优良自然变异, 水稻自然变异的发掘能够与突变体研究相辅相成, 包括产量、抗性基因等, 挖掘这些有利自然变异将为 加强人们对一些基础生物过程(如开花时间的调控) 培育更好的品种打下基础. 许多重要农艺性状都属 的理解, 因此, 自然变异的分子机制研究在理论和育 于数量性状, 会受到多个自然变异位点调控, 称为数 种实践中都有重要价值. 量性状基因座(quantitative trait locus, QTL), 不同位 点对表型效应的贡献不同, 且有的位点可能存在与 1 水稻自然变异的特点及研究策略 遗传背景和环境的互作效应, 因此对这些位点进行 遗传分析和基因克隆相对困难. 随着水稻参考基因 1.1 自然变异的复杂性及分析方法 组的完善及分子标记技术的发展, 结合相应统计模 大部分农艺性状由多个QTL位点控制, 根据对 型的提出, 现在研究者已经能够对不同种质自然变 表型的贡献不同, 可分为主效位点和微效位点. 一般 异的遗传基础进行分析, 并挖掘其中的有利位点. 而 认为贡献率达到15%即为主效位点. 但主效和微效 且随着高通量测序技术的成熟及成本降低, 高密度 是相对的, 取决于一个性状由多少位点调