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Agilent Pathway Architect 从现象到科学 代谢组学 蛋白质组学 PATHWAY ARCHITECT 基因组学 转录组学 AGILENT PATHWAY ARCHITECT 加速从发现到理解的进程 如今的科学家面临着严峻的挑战，他们需要分析越来越大和越来越复杂的数据 集，如基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学实验所产生的数据集。分 析数据的整合通路方法可以显著降低难度，达到生物学研究的最终目的，即理 解测量结果背后的生物学意义。将多种分析数据转化为生物学理解的成功方法 是将处理后的数据投射并显示在生物通路中。 使用以通路为中心的视图分析数据 使科学家能够： • 将化合物和组学结果与已知生物 代谢组学 蛋白质组学 学理论建立联系 • 通过直接关联生物学意义，更好 地聚焦研究目标 PATHWAY ARCHITECT • 整合多组学成果，实现更全面的 解析 • 提出假说并指导未来的实验 基因组学 转录组学 2 获得深入见解 Agilent Pathway Architect 软件是 GeneSpring 和 Mass Profiler Professional (MPP) 的一个可选 模块，它为科学家提供了一个深入理解数据的无缝平台。它可使用户获得单组学 或多组学的实验结果，并将结果映射到标准生物通路中，同时对通路信息进行分 析、查看与解析。这一以通路为中心的工作流程加速了从发现、解析到验证的进 程。它还使研究人员能够高效规划并执行其后续实验。 Pathway Architect 中显示的 KEGG 中的嘌呤代谢通路。代谢物（蓝色圆圈）和基因/蛋白质（黄色矩形） 表示与输入实体列表的匹配结果。 3 让结果可视化 Pathway Architect 是一款可视化工具，它采用公共通路数据库来促进对生物学结果的 理解。软件可将代谢物、蛋白质和基因投射到人工注释的通路中，并将数据以图形 形式投射于通路的节点或边缘，以便进行交互式用户分析。研究人员可以为特定生 物体指定搜索条件，并在将数据投射到特定通路之前浏览通路结果表。 通路数据库 • KEGG • WikiPathways • BioCyc • PathVisio 自定义通路 • GPML 格式 • BioPAX 格式 • 自然语言处理 (NLP) 选择 Pathway Architect 中可用的注释通路。 解决错误匹