北五味子内生细菌的分析-中国农学通报.pdfVIP

中国农学通报 2016,32(18): 100-103 Chinese Agricultural Science Bulletin 北五味子内生细菌的分析 曹 聪，梁抗抗，徐利剑，邵红涛，王 健，李雅菲，毕泽杏，王庆贵 （黑龙江大学农业资源与环境学院，哈尔滨150080） 摘 要：中国北五味子资源丰富，为了探明北五味子内生细菌的组成与多样性，从总DNA 中扩增出内生 细菌的rDNA ，选用焦磷酸测序法的MiSeq 平台去研究北五味子内生细菌的组成与多样性。发现了北 五味子内生细菌，分属于6 个菌门，9 个纲，17 目，27 个科，31 个属，39 个种。蓝藻门细菌为北五味子果实 内生细菌的优势菌，含量约为88.19% 。除此之外，肠球菌、乳球菌和芽孢杆菌这3 个属的细菌分别占据 其中的4.79% ，2.59%和1.11% ，其他细菌的总数占总量的3.32% 。细菌多样性分析方面，Shannon 指数为 0.633 ，Chao 指数为39 和Simpson 指数为0.781。利用高通量测序的方法，研究了北五味子内生细菌的组 成与多样性，发现与其他植物的细菌多样性相比，北五味子果实中内生细菌多样性较低。 关键词：五味子；内生细菌；高通量测序；蓝藻门 中图分类号：Q938.1 文献标志码：A 论文编号：cas EndophyticBacteriafromSchisandrachinensis CaoCong,LiangKangkang,XuLijian,ShaoHongtao,WangJian,LiYafei,BiZexing,WangQinggui (CollegeofAgriculturalResourceandEnvironment,HeilongjiangUniversity,Harbin150080) Abstract:Theresourceof Schisandra chinesis isrichinChina.Inordertoinvestigatethecompositionand biodiversityofendophyticbacteriafrom Schisandra chinesis,thebacterialrDNAwasamplifiedfromtotal DNA,andthenthecompositionandbiodiversityoftheendophyticbacteriafrom Schisandra chinesis were analyzedbypyrosequencingMiSeqmethod.Itwasfoundthattheendophyticbacteriabelongedto 6 phyla, 9 classes, 17 orders, 27 families, 31 generaand 39 species,respectively.Cyanobacteriawerethedominant bacteriaanditscontentwasapproximately 88.19%.ExceptforCyanobacteria,Enterococcus,Lactococcusand Bacillus,threegenera,represented 4.79%, 2.59%, 1.11%ofthetotalbacteria.Otherbacteriaaccountedfor 3.32%ofthetotal.Withrespecttothebiodiversityofbacteria,Shannonindexwas 0.633,Chaoindexwas39 and Simpson index was 0.781. The composition and biodiversity of endophytic bacteria from Schisandra chinensiswereinvestigatedbyusinghigh-throughputsequencingmet