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甲基化表观遗传学PPT

Company Logo LOGO DNA甲基化 ———表观遗传学 DNA的甲基化 真核生物的DNA甲基转移酶 DNA的去甲基化 DNA甲基转移酶的抑制剂 主要内容 (一)DNA的甲基化 1. DNA甲基化:在DNA甲基转移酶(DNAmethyltransferase,DNMTs) 的作用下,将一个甲基添加的胞嘧啶的5’-碳分子上,形成5-甲基化胞嘧啶(5-methylcytosine) 2.胞嘧啶甲基化后产生5-甲基化胞嘧啶能够自发的脱氨基形成胸腺嘧啶(Thymine):5mC - T 3. 哺乳动物中,~1%的DNA碱基能够发生甲基化修饰 4. DNA甲基化的分布: (1)转座子 (2) 逆转录病毒衍生的重复序列 (3) 大多数功能基因的编码区 1.DNA的甲基化 1. DNA甲基化的模式: (1) 线虫:无甲基化的胞嘧啶 (2) 果蝇:极少量的甲基化胞嘧啶,识别模式CpT (主要) vs. CpG (极少) (3) 哺乳动物:CpG (~70%)或者CpNpG 2.CpG– Cytosine phosphate Guanine 3. 镶嵌的甲基化(mosaic methylation): 基因组中,高度甲基化的部分DNA序列被大的非甲基化DNA序列所分隔开 4.难以被DNA修复系统所识别: CG→TG是可遗传的 2.DNA的甲基化的过程 直接干扰机制 间接机制 (1)The methyl-CpGbinding Proteins MeCP1 and MeCP2能够与甲基化的DNA结合 (2)MeCP2能够招募Sin3a,HDACs,形成复合物,阻遏转录 4.DNA甲基化的作用机制 (二)真核生物的DNA甲基转移酶 1. 哺乳动物: DNMT1,DNMT3A,DNMT3B,DNMT3L, DNMT2 2. 拟南芥:DRM2, MET1,DNMT2, CMT3 3. 粗糙脉孢菌(Neurospora crassa): DIM2,dim-5, RID DNA甲基转移酶的功能 (三)DNA的去甲基化 1. DNA去甲基化(DNA demethylation): 5甲基胞嘧啶(5mC) 替代成胞嘧啶的过程 2. 两种方式 (1) 主动去甲基化(Active DNA demethylation) A. Bona fide demethylation B. Indirect demethylation (2) 复制相关的去甲基化(Replication-coupled DNA Demethylation) 去甲基化 1. 5-甲基胞嘧啶去甲基化酶将5-甲基胞嘧啶水解成胞嘧啶和水 2. 5-甲基胞嘧啶/DNA糖基化酶将5-甲基胞嘧啶从磷酸二脂键骨架中切除,然后通过内切酶修复 (四)DNA甲基转移酶抑制剂 1. 核苷类DNA甲基转移酶抑制剂 2. 非核苷类DNA甲基转移酶抑制剂 核苷类DNA甲基转移酶抑制剂 1. 5-azacytidine: 第一个发现的甲基化抑制剂。有细胞毒性,低剂量能够治疗白血病 2. 5-aza-2’-deoxycytidine: 诱导细胞增生的停止 3. Zebularine:5-azacytidine的衍生物 4. FCDR:5-Fluoro-2-deoxycytidine 5. 作用机理:在体内通过代谢形成三磷酸脱氧核苷,在DNA复制过程中代替胞嘧啶,与Dnmts具有很强的结合力(suicide substrates (a) EGCG: 绿茶中的聚苯复合物 (b)RG108: 小分子,阻遏Dnmt的活性中心 (c) 4-amino-benzoic acid衍生:Procainamide (d) Psammaplins (e) 寡聚核苷酸:MG98 Company Logo LOGO

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