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2013.11.15基因工程
基因工程
Genetic Engineering;相关概念
DNA克隆
工具酶
目的基因
基因载体
基本原理
重组DNA技术与医学的关系;一、重组DNA技术相关概念 ;技术水平:分子克隆(molecular clone)
即DNA 克隆
细胞克隆
个体克隆(动物或植物) ;DNA克隆
应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质(同源的或异源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA)与载体DNA接合成一具有自我复制能力的DNA分子——复制子(replicon),继而通过转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增提取获得大量同一DNA分子,也称基因克隆或重组DNA (recombinant DNA) 。 ;(二)工具酶;重组DNA技术中常用的工具酶;限制性核酸内切酶;第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;
第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;
第四个字母代表株;
用罗马数字表示发现的先后次序。;定义
核酸外切酶是一类能从多核苷酸链的一端开始催化水解3’5’-磷酸二酯键,降解核苷酸的酶。其水解的最终产物是单个的核苷酸(DNA为dNTP,RNA为NTP)。;限制性内切酶(restriction endonuclease)是DNA操作过程中所使用的基本工具。
特异性地结合于一段被称为限制酶识别序列的特殊DNA序列之内或其附近的特异位点上,并在此切割双链DNA。
分子克隆中常用的为II类限制酶,其识别位点长度为4、5或6个核苷酸的反向重复序列。;Ⅱ类酶识别序列特点—— 回文结构(palindrome) ;★ 平末端在识别顺序的中心对称轴处切割;★ 3’端粘性末端在识别顺序的双侧末端切割DNA双链,于对称轴的3’末端切割。;5’ G-A-A-T-T-C 3’
3’ C-T-T-A-A-G 5’;名 称 识别序列及切割位点;同功异源酶
来源不同的限制酶,但能识别和切割同一位点,这些酶称同功异源酶。;同尾酶
有些限制性内切酶虽然识别序列不完全相同,但切割DNA后,产生相同类型的粘性末端,称为同尾酶。这两个相同的粘性末端称为配伍未端(compatible end)。;cDNA (complementary DNA)
指经反转录合成的、与RNA (通常指mRNA或病毒RNA)互补的单链DNA。以单链cDNA为模板、经聚合反应可合成双链cDNA。
基因组DNA (genomic DNA)
指代表一个细胞或生物体整套遗传信息(染色体及线粒体)的所有DNA序列。 ;(四)基因载体;克隆载体(cloning vector)
为使插入的外源DNA序列被扩增而特意设计的载体称为克隆载体。
表达载体(expression vector)
为使插入的外源DNA序列可转录翻译成多肽链而特意设计的载体称为表达载体。;载体的选择标准;;1. 质粒 (plasmid);λ噬菌体DNA改造系统
λgt系列(插入型,适用cDNA克隆)
EMBL系列(置换型,适用基因组克隆);;酵母人工染色体
(yeast artificial chromosome, YAC)
细菌人工染色体
(bacterial artificial chromosome, BAC)
动物病毒DNA改造的载体
(如腺病毒,腺病毒相关病毒,逆转录病毒);二、重组DNA技术基本原理; 以
质
粒
为
载
体
的
DNA
克
隆
过
程;(一)目的基因的获取;* 化学合成法获取目的基因;组织或细胞染色体DNA;限制酶切位点;mRNA ;通过PCR获取目的基因 ;PCR?技术实际上是在模板DNA、引物和4?种脱氧核苷酸存在的条件下依赖于耐高温DNA?聚合酶的体外酶促合成反应。
PCR?技术的特异性取决于引物和模板DNA?结合的特异性。反应分为三步:1?热变性:在高温条件下,DNA?双链解离形成单链DNA;2?退火:当温度突然降低时引物与其互补的模板在局部形成杂交链;3?延伸:在DNA?聚合酶、dNTPs?和Mg2+存在的条件下,聚合酶催化以引物为起始点的DNA?链延伸反应。以上三步为一个循环,每一循环的产物可以作为下一个循环的模板。;目的不同,操作基因的性质不同,载体的选择和改建方法也不同。 ;(三)外源基因与载体的连接;Bam HⅠ切割反应;不同限制酶切位点(非配伍末端)的连接;2. 平端连接
适用于:限制性内切酶切割产生的平端
粘端补齐或切平形成的平端;目的基因;3. 同聚物加尾连接
在末端转移酶(terminal transferase)的作用下,在DNA片段末端加上同聚物序列、制造出
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