从松属相关物种筛选红松微卫星标记及其种群遗传多样性-生态学杂志.pdfVIP

生态学杂志ChineseJournal of Ecology摇 2013,32(9):2307-2313 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 从从松属相关物种筛选红松微卫星标记及其 种群遗传多样性分析* 1,2 1,2 1** 张摇 悦 摇 易雪梅 摇 姬兰柱 1 2 ( 中国科学院沈阳应用生态研究所,森林与土壤生态国家重点实验室,沈阳110016; 中国科学院大学,北京 100049) 摘摇 要摇 近缘物种筛选法是获取微卫星引物的主要方法之一。 利用松属植物EST鄄SSRs 的 种间通用性,从马尾松微卫星引物中筛选出红松EST鄄SSR 标记,并与已有的红松基因组 SSR标记进行对比分析。 采集长白山露水河红松母树林4 个种群的248 个样本,分析种群 遗传多样性。 结果表明:马尾松与红松的种间通用率为27.27%,松属内不同亚属物种间的 种间通用性偏低;与红松基因组SSRs相比,EST鄄SSRs 的单位点等位基因数(N )、有效等位a 基因数(N )、观测杂合度(H )、期望杂合度(H )等遗传多样性参数均较低;用2 组引物分e o e 析4 个种群的遗传多样性,发现有效等位基因均能反映出不同种群遗传变异的趋势,基因 多样性均能反映出遗传同一性的差异,说明两组引物都能准确地反映红松种群的遗传多态 性水平,新筛选的EST鄄SSRs可以用于红松种群遗传多样性研究。 关键词摇 表达序列标签;基因组微卫星;种间通用性;种群遗传学分析;松属植物;长白山 中图分类号摇 Q37摇 文献标识码摇 A摇 文章编号摇 1000-4890(2013)9-2307-07 Screening of Pinus koraiensis microsatellite makers from relative species of Pinus and 1,2 1,2 1** 1 analysis of population genetic diversity. ZHANGyue ,YI Xue鄄mei ,JI Lan鄄zhu ( In鄄 stitute of Applied Ecology,Chinese Academy of Sciences,State Key Laboratory of Forest and Soil 2 Ecology,Shenyang 110016,China; University of ChineseAcademy of Sciences,Beijing 100049, China).Chinese Journal of Ecology,2013,32(9):2307-2313. Abstract:Screeningrelative speciesSSRsisone of the main methodsfor obtaining microsatellite makers. Basedontheinterspecifictransferability ofPinus EST鄄SSRs,thispaper screenedoutthe EST鄄SSRs ofPinus koraiensis fromthem