北京市西城区手足口病患儿肠道病毒71型VP1区基因进化分析_吉彦莉.pdfVIP

·22 · 2016 27 2 J of Pub Health and Prev Med ，Apr. 2016 ，Vol. 27 No. 2 公共卫生与预防医学 年第 卷第 期 · · 论 著 71 北京市西城区手足口病患儿肠道病毒 型 VP1 区基因进化分析 ， ， ， ， ， ， 吉彦莉 杨青俊 王永全 崔海洋 靳博 胡三梅 孔庆征 ， 100120 北京市西城区疾病预防控制中心 北京 : 2015 (HFMD) 71 (EV 71 ) VP1 ， 摘要 目的 了解北京市西城区 年手足口病 患儿肠道病毒 型 分离株 区基因特征 分析其变异 。 2015 HFMD EV 71 ， 、 ， 情况 方法 收集北京市西城区 年 病原学检测分型鉴定为 的阳性标本 对部分标本进行病毒分离 培养 PCＲ 。EV 71 ， VP1 PCＲ 。 并通过实时荧光 鉴定阳性培养物 阳性培养物提取病毒核酸 对其 区全长序列进行 扩增和测序 从 Genbank EV 71 ， 。 6 中选取 不同基因型别参考序列 利用生物信息学软件进行同源性和系统进化分析 结果 共分离到 株 EV 71 (Genbank KU376383 － KU376388) 登录号为 ， VP1 93. 00% ～ 99. 00% 98. 00% 其 区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为 和 ～ 100. 00% ， 参考序列VP1 区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81. 00% ～ 97. 00% 和93. 00% ～ 100. 00% 。进化分析显 与 ，6 EV 71 C4a 。 2015 EV 71 C4a ， 。 示 株 均为 基因亚型 结论 年北京市西城区 流行株属于 亚型 未出现明显变异 :