香蕉基因组测序及胁迫相关功能基因研究进展.pdfVIP

中国生物工程杂志　ＣｈｉｎａＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１２，３２（３）：１１０１１４ 香蕉基因组测序及胁迫相关功能基因研究进展 １ １ １ １ ２ １ １，２ 刘菊华 　徐碧玉 　张建平 　贾彩红 　王甲水 　张建斌 　金志强 （１中国热带农业科学院热带生物技术研究所　农业部热带作物生物技术重点开放实验室　海口　５７１１０１） （２中国热带农业科学院海口实验站　海口　５７０１０２） 摘要　香蕉是重要的热带水果之一，是世界第四大粮食作物。香蕉抗性相关的功能基因组学研 究一直是香蕉研究的热点和核心。综述了近年来香蕉基因组测序、胁迫相关功能基因分离和鉴 定等方面的最新研究进展，将有助于从源头上对香蕉进行创新性的研究，为香蕉遗传改良和新品 种培育提供一定的理论依据。 关键词　香蕉　基因组测序　胁迫　功能基因 中图分类号　Ｑ７５ 　　香蕉（ＭｕｓａａｃｃｕｍｉｎａｔａＣｏｌｌａ）是重要的热带水果， ［１］ １　香蕉基因组测序进展 是世界第四大粮食作物 ，对发展中国家脱贫致富具 有非常重要的作用。香蕉对环境的适应性较强，周年 　　香蕉的二倍体基因组小，为５００～６００Ｍｂ，仅为水 都有果实生产，因此是其他大宗作物青黄不接时期人 ［２］ 稻的１／４，分布于１１条染色体上 。由于相对较小的 类的重要营养来源。香蕉富含丰富的矿质营养元素和 基因组，使得运用高通量的技术完成其序列分析及功 维生素Ａ、Ｃ和Ｂ等。香蕉果实在剥皮生食之前是无 ６ 能鉴定成为可能。早在２００１年７月１７～１９日召开的 菌的，是易于被人们取食的最干净安全的固体食物，因 美国国家科学基金会议上，来自欧洲、美洲和澳大利亚 此香蕉是生产口服疫苗和药用蛋白的最理想的工具之 等１１个国家的科学家就成立了全球香蕉基因组联盟 一。香蕉还是植物基因组学研究的最佳模式之一。首 （ＧｌｏｂａｌＭｕｓａＧｅｎｏｍｉｃｓＣｏｎｓｏｒｔｉｕｍ，ＧＭＧＣ）并宣布他们 先，香蕉是具有双亲胞质遗传特性，即父本的线粒体和 将精诚合作对香蕉基因组进行测序，利用香蕉作为一 母本的叶绿体遗传特性的少数几种植物之一。其次， 种模式植物来研究比较基因组学和功能基因挖掘，最 香蕉同时具有不育性、无性繁殖和单性结实，使其为研 终以培育香蕉新品种为目的。后来，联盟成员增加至 究在不同染色体环境下的特异基因的表达提供了难得 ２４国家的４０个研究所。 的机会。再次，香蕉除了二倍体ＡＡ、ＢＢ、ＡＢ外，不仅有 　　２００４年，比利时的科学家首次对香蕉基因组的构 很多的同源多倍体（ＡＡＡ、ＡＡＡＡ、ＡＡＡＡＡＡ），也有很多 成进行了报道。他们获得了一个全长８２７２３ｂｐ、ＧＣ含 的异源多倍体（异源三倍体：ＡＡＢ、ＡＢＢ；异源四倍体： 量为３８．２％的ＢＡＣ克隆（ＭｕＨ９），共编码１２个功能蛋 ＡＡＢＢ、ＡＡＡＢ），这使得香蕉成为研究栽培作物进化、在 白质，基因密度为１／６．９ｋｂ，该结果比已报道的拟南芥 染色体和序列水平上分析亲