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分子生物学
(田生礼&胡章立)
1.DNA复制起始位点的特征是什么?
答:复制时,双链DNA要解开成两股链分别进行,所以,这个复制起点呈现叉子的形式,被称为复制叉。对一个生物体基因组而言,复制起点是固定的,表现为固定的序列,并识别参与复制起始的特殊蛋白质。
2.DNA二级结构分几类?各类的结构特征是什么?
答:通常情况下DNA二级结构分成两大类,右手螺旋有A-DNA和B—DNA,左手螺旋有Z-DNA。DNA的水溶液通常为B-DNA,另外A-T丰富的DNA片段常呈现B-DNA。DNA的双链中一条被相应的RNA所取代,就会形成A-DNA。如,在杂交分子或DNA处于转录状态时。B-DNA中的多聚G-C区易形成左手螺旋DNA,即Z-DNA。
其中B-DNA是最常见的DNA构象,而A-DNA和Z-DNA似乎不具有生物活性。
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较
双螺旋 碱基倾角/(o) 碱基间距/nm 螺旋直径/nm 每轮碱基数 螺旋方向 A-DNA 20 0.26 2.6 11 右 B-DNA 6 0.34 2.0 10 右 Z-DNA 7 0.37 1.8 12 左
3.核小体的构成成分是什么?染色体是如何被包装的?
答:核小体:200个左右碱基对的DNA与四种组蛋白结合而成。
(1)H2A、H2B、H3、H4各两个组成八聚体,为核心DNA。
(2)146BP的DNA在外1.75圈。
(3)H1于核心颗粒外20bp处。
(4)两个相邻核小体以0~80bpDNA连接(物种间有差异)。
核小体的形成只是DNA包装成染色体的第一步,当离子强度较高且有H1存在时,大量10nm的纤维状染色质细丝(由核小体串联而成)会盘绕成螺旋管状的粗丝,统称螺线管,每个螺旋包含6个核小体,它是分裂间期染色质和分裂中期染色体的基本组分,并可进一步压缩为超螺旋。
4.染色体的组成成分哪些?组蛋白与非组蛋白的特征有哪些?
答:基本组成成分:DNA、组蛋白、非组蛋白、少量RNA
(1)DNA:不重复序列、中度重复序列、高度重复序列(卫星DNA)
(2)组蛋白:富含Arg、Lys碱性AA,带正电荷,与DNA带负电荷磷酸基团相互作用。四种:H1、H2A、H2B、H3及H4。特征:①进化上极端保守(H3、H4H2A、H2BH1②无组织特异性(极少不含H1而含H5③肽链上AA分布不对称④修饰作用:甲基化、乙酰化、磷酸化、ADP核糖基化、H3、H4作用普遍。⑤H5富含Lys,有种特异性,与H1无明显血缘关系。
特征:①进化上的极端保守性;②无组织特异性;③肽链上Aa分布的不对称性;④组蛋白的修饰作用;⑤富含Lys的组蛋白H5。
(3)非组蛋白:序列特异性DNA结合蛋白,包括酶类、骨架蛋白、核孔复合物蛋白及肌动蛋白、肌球蛋白、微管蛋白、原肌蛋白等。①HMG蛋白②DNA结合蛋白③A24非组蛋白,它们也可能是染色质的结构成份。
5.E.coli DNA聚合酶的组成成分及其功能是什么?
答:E.coli DNA聚合酶由Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三种组成。
1、都需要模板指导,以dNTP作为底物,且需要3’-OH的引物链,聚合反应方向为5’ (3’。
2、都有3’(5’外切活性,起核对作用。
3、Ⅰ有Ⅱ、Ⅲ无5’(3’外切活性。
4、Ⅰ为单一多肽链,Ⅱ、Ⅲ为亚基酶。
E.coli DNA聚合酶Ⅰ不是复制E.coli 染色体的主要聚合酶,而起了主要的修复作用,在半保留复制中起辅助作用,有5’→3’聚合功能端粒酶是一种核酸蛋白复合体(RNP)结构,能以酶本身的RNA成分上的一个片段(RNA核心)为模板合成端粒重复序列,为染色体的DNA末端加尾,或修补已断裂染色体的末端,维护基因组的遗传稳定性。真核生物的端粒复制是一种无模板的从头复制。端粒酶对端粒的加尾是以其内部的RNA核心序列为模板进行的,不需要染色体末端DNA的模板作用。由于染色体末端重复序列中富G(G—rich)链的5'→3'方向总是指向染色体末端,并且比其反向链长出若干个核苷酸,因而其向外突出的3'端就成了端粒酶识别和结合的位点。端粒酶首先对已有的3'末端进行识别和结合,然后根据内设RNA 模板,拷贝(逆转录)出互补的DNA链。端粒DNA的G—rich链经过端粒酶“自主性”地延长后,再通过G—G配对使其终端形成回折,这样DNA复制时新链5'端缺失就可以得到补齐DNA聚合酶Ⅱ相同,最适模板也是链DNA中间有空隙的单链DNA,单链结合蛋白可以提高该酶催化单链DNA模板的DNA聚合作用。DNApolⅢ也有3→5和5→3外切酶活性,但是3→5外切酶活性的最适底物是单链是DNA,只产生5-单核苷酸,不会产生二核苷酸,即每次只能从3端开始切除一个核苷酸。5→3外切酶活性也要求有单链DNA为起始作用底物,但一旦开始后,便可作用于双链区。DNA聚合酶Ⅲ是细
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