石斑鱼循环水养殖系统微生物群落结构-中国水产科学.PDFVIP

中国水产科学 2017 年9 月, 24(5): 10451054 Journal of Fishery Sciences of China 研究论文 DOI: 10.3724/SP.J.1118.2017.16349 石斑鱼循环水养殖系统微生物群落结构 吴越, 马建忠, 郑伊诺, 许凯伦, 李敏, 陈星星, 胡园, 曾国权, 黄振华 浙江省海洋水产养殖研究所, 浙江 温州 325005 摘要: 通过 16S rRNA 基因片段高通量测序研究了褐点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)和东星斑(Plectropomus leopardus) 循环水养殖系统水体细菌种群结构。结果显示石斑鱼循环水养殖系统中优势细菌类群为变形菌门 (Proteobacteria) 、拟杆菌门(Bacteroidetes) 、蓝藻门(Cyanobacteria) 、梭杆菌门(Fusobacteria) 、厚壁菌门(Firmicutes) 和硝化螺旋菌门(Nitrospira) 。其中养殖塘、固液分离池、沉淀池和蛋白分离池中主要优势细菌为γ-变形菌纲 (Gammaproteobacteria), 紫外消毒池和补氧池中则以-变形菌纲(Alphaproteobacteria)为主, 而生物滤池中两者比例 接近, 均为优势种群。从养殖塘到补氧池细菌多样性指数先降低后升高, 生物滤池中达到最高值, 之后再次下降至 紫外消毒池中达到最低值, 补氧池中有所回升。PCoA 分析和聚类分析结果表明, 养殖水在紫外消毒前后其细菌群 落组成有着明显的差异。水质理化指标检测表明, 经过净化处理后, 循环系统的养殖水溶解氧含量上升, 氨氮和亚 硝酸盐含量下降并维持在较低的浓度。环境因子与细菌群落结构相关性分析结果表明, 磷酸盐、pH 、溶解氧和温 度等指标可能对细菌群落结构影响相对较大, 但未发现两者间有很显著的相关性, 这可能与实验样本较少有关。 关键词: 石斑鱼; 循环水养殖系统; 养殖水体; 细菌群落; 高通量测序 中图分类号: S965 文献标志码: A 文章编号: 10058737(2017)05104510 石斑鱼(Epinephelus)是名贵的海洋经济鱼类。 生态多样性上仍然存在一定局限性[6−7] 。宏基因学 20 世纪 70 年代中国开始进行石斑鱼人工养殖实 (metagenomics) 以环境中微生物基因组总和为研 验, 至今已经有30 多年历史[1] 。现有石斑鱼养殖 究对象, 通过测序分析和功能基因筛选等手段, 可快 [8−10] 以网箱和池塘为主, 循环水养殖提供了一种高效 速有效地分析水体微生物群落的构成和功能 。 利用水资源的养殖方式, 可大大降低养殖业对环 在水产养殖中, 细菌 16S rRNA 高通量测序开始 境的污染程度, 且又具有养殖系统自身水质稳 成为研究养殖环境微生物种群结构的新手段。 [2] 定、防病能力强等优势 。 本研究将细菌 16S rRNA 高通量测序技术运 水产养殖中水质变化与环境微生物紧密相关, 用于石斑鱼循环水养殖系统水体中微生物种群结构 当养殖环境水体理化性质改变时, 微生物群落结 的研究, 旨在为构建健康养殖系统提供理论依据。 构会相应产生变化[3] 。传统的微生物种群结构研 1 材料与方法 究主要基于微生物分离和培养技术, 可研究种类 十分有限[4−5] 。随着分子生物学技术的发展, DNA