巨桉纤维素合酶Ces家族的生物信息学分析.pdf

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巨桉纤维素合酶Ces家族的生物信息学分析

2014 30 2 15 广 东林业科技 年第 卷第 期 * 巨桉纤维素合酶Ces 家族的生物信息学分析 徐 双 曾炳山 范春节 刘 英 李湘阳 裘珍飞 ( , 东广州510520) 中国林业科学研究院热带林业研究所 广 摘要 纤维素合酶( Cellulose synthase ,Ces) 基因家族成员负责催化纤维素的合成 。利用 Phytozome 网站 ( Eucalyptus grandis) , 31 Ces , 18 对巨桉 全基因组序列进行检索 共发现 条蛋白质序列属于 家族 其中包括 个 CesA 13 CslD 。 ClustalW、Protparam 、TMHMM , 31 亚族成员与 个 亚族成员 使用 等生物学在线服务器 对巨桉 Ces , : 31 Cellulose synthase 个 家族成员进行全面生物信息学分析预测 结果显示 条蛋白质序列均具有 特征性 , Ces ; Ces Ces 、 Ces 、 、 保守结构域 具有 家族成员特征 巨桉 家族与拟南芥 家族 杨树 家族在亚族种类 成员组成 ; 、 、 、 、 蛋白理化性质方面存在变异性 蛋白结构域 二级结构 跨膜区预测 无序性 亚细胞定位分析结果存在保守 性 。 ; ; 关键词 巨桉 纤维素合酶家族 生物信息学分析 中图分类号:S718. 46 文献标识码:A 文章编号:1006 - 4427 (2014)02 - 0015 - 08 Bioinformatics Analyses of the Ces Gene Family in Eucalyptus grandis XU Shuang ZENG Bingshan FAN Chunjie LIU Ying LI Xiangyang QIU Zhenfei (Research Institute of Tropical Forestry ,Chinese Ac

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