氨基酸、多肽与蛋白质－1－中文－2008 - 生物化学与分子生物学.ppt

Biochemistry生物化学 研究内容 一、生物分子的结构与功能：探讨生物体的物质组成以及分子结构、性质和功能 二、物质代谢及其调节：物质代谢的规律、能量转化及其调节控制 ……属静态生化 三、基因信息传递规律及其调控：DNA复制、RNA转录、蛋白质翻译、基因表达调控等 通常将生物大分子结构、功能及其代谢调控的研究称为分子生物学（生物大分子的来龙去脉） …… 属动态生化 学习方法 特点一：与数理化不同，尚未进入定量科学的阶段，还处于定性科学阶段。因此不可能通过公式或定理推出一个准确的结论 特点二：生物界没有绝对，几乎所有的结论都可以被一些例外打破（生物多样性） 一般性结论与要求：课前预习数遍（看小说），课堂上专心听讲（最省时省力），课后及时复习（重要），择重记忆（概念为主---记忆为主，在记忆的基础上加以理解） Tricks：早上一定要吃富含糖类的早餐（补充血糖）…… 生物化学的发展简史 起始阶段（18世纪--20世纪初）：研究了脂类、糖类及氨基酸；发现了核酸；酵母发酵中的“可溶性催化剂”----酶的概念等 快速发展阶段（20世纪初--下叶）：必需氨基酸、维生素的发现；酶的蛋白质本质揭示；多种激素的发现；主要物质代谢途径的确定等 分子生物学的崛起阶段（20世纪下叶--）： 分子生物学的重要事件 50年代：蛋白质α-螺旋结构的发现； 53年Watson和Crick提出了DNA双螺旋结构模型----分子生物学的里程碑；中心法则的提出；遗传密码的破译…… 70年代：DNA重组技术(基因工程)、基因诊断、基因治疗的发展 80年代：核酶（ribozyme）、PCR技术等 90年代---：人类基因组计划（约3.0×109碱基、2-3万个基因）、后基因组时代（蛋白质组学、生物信息学……） 第一篇生物大分子的结构与功能 一、蛋白质 （protein） 二、核酸（nuclear acids） 三、酶 （enzyme） 氨基酸的种类 1809年发现Asp，1938年发Thr，目前已发现180（《生物化学》第三版 王镜岩）/300多种 构成蛋白质的20种氨基酸的结构特点： 1.均为L-α氨基酸，各种aa的R侧链各不相同 2.α-碳原子上均连有一个氨基(脯氨酸除外) 3.α-碳原子为手性碳原子(甘氨酸除外） 近年来发现，谷胱甘肽过氧化物酶中存在由终止密码UGA编码的硒代半胱氨酸，可能是第21种蛋白质氨基酸；目前，第22种氨基酸吡咯赖氨酸 （一）氨基酸的分类 肽peptide 氨基酸在形成肽链时失去了一分子水，肽链中的氨基酸分子不再完整，称为氨基酸残基(amino acid residue) 由下丘脑分泌，其功能是促进腺垂体释放促甲状腺素(调节糖代谢) 一、蛋白质的一级结构 蛋白质一级结构的概念： 蛋白质分子中所有氨基酸的排列顺序， 主要化学键：肽键，二硫键 氨基酸序列书写： 以氨基端开始,羧基末端结束 依次编1、2、3……… 二、蛋白质二级结构 概念： 是指蛋白质分子中一段多肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及到aa侧链R基团的构象 肽单元（肽平面）： 肽键的6个原子Cα1 、C、N、O、H、 C α2位于同一平面，构成所谓的肽单元 肽键的特点： 肽键的特点 蛋白质的二级结构类型 （二）β－折叠(β－pleated sheet) 2. β－折叠结构特点 （三）β－转角(β－turn) 三 蛋白质的三级结构 四 蛋白质的四级结构 (quaternary structure) 二、 蛋白质的分离纯化 (四) 层析 层析种类： 凝胶过（分子筛） 离子交换层析（阴离子和阳离子） 亲和层析 四、蛋白质空间结构的测定 1.一级结构相似的蛋白质功能相似 一级结构不同的蛋白质功能不同 胰岛素的一级结构及种属差异 （二）一级结构与功能的关系 ACTH 促肾上腺素皮质激素 MSH 促黑激素 一级结构不同的蛋白质功能不同 HbS与HbA的区别 Β-亚基第6位氨基酸 正常人：Glu 患者：Val 由4个亚基组成 血红蛋白 功能:运输O2 二、蛋白质空间结构与功能的关系 （一）肌红蛋白Mb与血红蛋白Hb 蛋白质的空间结构决定生物学功能 肌红蛋白（1个亚基）与血红蛋白（4个亚基）且一级结构有较大差异，但均具有与氧可逆地结合的能力 其结构特点是，都与血红素（辅基）共价结合 O2 O2 （二）血红蛋白构象变化与结合氧的能力 变构效应 蛋白质分子与它的配体结合后构象发生变化, 其功能也随之变化的现象,称为变构效应 协同效应 蛋白质分子中的1个亚基与其的配体结合后, 能影响其它亚基与配体的结合,称为协同效应 促进 正协同效应 抑制 负协同效应 血红蛋白与氧结合的正协同效应 氧饱和