生物信息学数据库研究文献引文与热点分析.pdfVIP

第 １２卷 第４期 生 物 信 息 学 Ｖｏｌ．１２Ｎｏ．４ 　　　　　　　　　　 ２０１４年１２月 ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ Ｄｅｃ．，２０１４ － ｄｏｉ：１０３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ２０１４．０４．１２ 生物信息学数据库研究文献引文与热点分析 １ １，２ 王　蕊 ，胡德华 （１．中南大学湘雅医学院，长沙４１００１３； ２．湖南省高等学校医学信息研究重点实验室，长沙４１００１３） 摘　要：以ＷｅｂｏｆＳｃｉｅｎｃｅ为数据源，简要概括生物信息学数据库研究的发展趋势。利用ＣｉｔｅＳｐａｃｅ可视化工具展现生物信息 学数据库研究的知识基础和研究热点图谱，为开展生物信息学数据库领域相关的理论研究和实践活动提供借鉴，以便推动生 物信息学数据库研究的发展。研究表明：１９９０年ＡｌｔｓｃｈｕｌＳＦ发表的“局部比对搜索工具———ＢＬＡＳＴ”是生物信息学数据库研 究的重要知识来源文献；热点主题集中在序列库、基因组数据库、分类数据库、蛋白质数据库、数据库更新、集成系统等。 关键词：生物信息学数据库；ＣｉｔｅＳｐａｃｅ；研究热点；可视化分析 － － － － － 中图分类号：Ｒ １　　文献标志码：Ａ　　文章编号２０１４）０４３０５０８ Ａｎａｌｙｓｉｓｏｆｃｉｔａｔｉｏｎｆｅａｔｕｒｅｓｉｎｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｄａｔａｂａｓｅｌｉｔｅｒａｔｕｒｅｓｔｕｄｉｅｓ １ １，２ ＷＡＮＧＲｕｉ，ＨＵＤｅｈｕａ （１．ＸｉａｎｇＹａＳｃｈｏｏｌｏｆＭｅｄｉｃｉｎｅ，ＣｅｎｔｒａｌＳｏｕｔｈＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈａｎｇｓｈａ４１００１３，Ｃｈｉｎａ； ２．ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＭｅｄｉｃａｌＩｎｆｏｒｍａｔｉｏｎＲｅｓｅａｒｃｈ，ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＨｕｎａｎＰｒｏｖｉｎｃｅ，Ｃｈａｎｇｓｈａ４１００１３，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＵｓｉｎｇｌｉｔｅｒａｔｕｒｅｄａｔａｆｒｏｍＷｅｂｏｆＳｃｉｅｎｃｅａｓｔｈｅｒｅｓｅａｒｃｈｓａｍｐｌｅ，ｗｅｂｒｉｅｆｌｙｓｕｍｍａｒｉｚｅｔｈｅｔｒｅｎｄｏｆ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｄａｔａｂａｓｅｒｅｓｅａｒｃｈｔｏｐｒｏｖｉｄｅｒｅｆｅｒｅｎｃｅｆｏｒｔｈｅｏｒｙｒｅｓｅａｒｃｈａｎｄｐｒａｃｔｉｃｅａｃｔｉｖｉｔｉｅｓａｎｄｔｏｐｒｏｍｏｔｅｔｈｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｄａｔａｂａｓｅｒｅｓｅａｒｃｈ．ＴｈｅｎｗｅｕｓｅｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｖｉｓｕａｌｉｚａｔｉｏｎｔｏｏｌｓｎａｍｅｄＣｉｔｅＳｐａｃｅｔｏ ｄｉｓｐｌａｙｔｈｅｋｎｏｗｌｅｄｇｅｓｏｕｒｃｅｓａｎｄｒｅｓｅａｒｃｈｆｏｃｕｓｅｓ．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｓｓｈｏｗｔｈａｔｔｈｅｅａｒｌｉｅｓｔｌｉｔｅｒａｔｕｒｅｗａｓＢａｓｉｃｌｏｃａｌ ａｌｉｇｎｍｅｎｔｓｅａｒｃｈｔｏｏｌｂｙＡｌｔｓｃｈｕｌＳＦｉｎ１９９０；ｔｈｅｒｅｓｅａｒｃｈｆｏｃｕｓｅｓｉｎｃｌｕｄｅｓｅｑｕｅｎｃｅｄａｔａｂａｓｅｓ，ｇｅｎｏｍｅｄａｔａｂａｓｅ， ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎｄａｔａｂａｓｅ，ｐｒｏｔｅｉｎｄａｔａｂａｓｅ，ｄａｔａｂａｓｅｕｐｄａｔｅｓ，ｉｎｔｅｇｒａｔｉｏｎｓｙｓｔｅｍ，ｅｔｃ． Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｄａｔａｂａｓｅ；ＣｉｔｅＳｐａｃｅ；Ｒｅｓｅａｒｃｈｆｏｃｕｓ；Ｖｉｓｕａｌｉｚａｔｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓ 　　生物信息学（Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ）是在生命科学的研 不同。依据数据类型可分为：核酸序列数据库、蛋白 究中，生物学与计算机科学及应用数学等多学科相