遗传学研究进展 复习资料.docxVIP

09年1, 功能基因组的研究内容和特点，你认为作物遗传改良过程如何应用功能基因组的方法与成果？2，你们实验室已完成或正在完成的有关genomics的课题，就研究背景，技术路线，预期结果与意义说明。3，linkage disequilibrium，haplotype，selection sweep4，SNP,SFP特点及应用5，EST？基于EST克隆的特点6，遗传操作途径和生物技术方法思考能源植物选育途径（英语答加10分）。7，多倍体形成和进化过程中遗传学，表观遗传学，基因表达的研究进展。8，转基因从事一方面研究：1）改良作物性状那些，为什么？2）哪些方法进行转基因研究？3）如何用转基因材料进行新品种选育？请给出2006年以来有关基因组研究的三个突出事例。（孟金陵）2.简述遗传转化在植物生物学研究和植物育种中的应用。（张献龙）3.请简述植物细胞周期调控的分子机理。试根据参与细胞周期调控的主要成员的 特点，讨论如何利用细胞周期基因研究植物生长发育的调控（可侧重一到两个（ 类）细胞周期基因进行阐述）4.简述SNP和SFP的概念、特点及其可能的检测方法。（余四斌）5.什么是连锁不平衡（linkage disequilibrium）？简述关联分析的原理。影响 LD 的因素有那些？（刘克德）6.简述一种常用植物基因表达分析技术及其原理、主要步骤(l廖玉才)能源植物的选育,转基因方法及如何选育转基因品种,EST,SNP,SFP,功能基因组,LD单倍体,基因扫荡,关联分析影响因子1．能源作物与能源植物的定义，选育方法及途径2．植物功能基因组学研究主要内容和特点。举一实例，谈谈如何应用植物功能基因组学研究作物遗传改良。3．一种从转录水平上的基因表达分析技术的方法和原理。4．连锁不平衡，单倍型，群落结构定义。关联分析的基本优点。5．植物远缘杂种和多倍体遗传及表观遗传研究进展。6．脱分化和再分化的研究机制7．哪些标记可用于遗传图谱的构建？8．根据植物基因组学原理，作为育种家谈谈对未来的作物育种策略。什么LD，单倍型，群体结构。关联分析的优点？连锁不平衡(LD)：染色体上不同位点的等位基因间的非随机关联。单倍型：指一条染色体上紧密连锁的分子标记位点的等位基因倾向一起传递给后代。群体结构是指等位基因频率在亚群间显著的不同，这取决于地理因素、遗传漂变、驯化或者选择等因素。关联分析的优点：一般以现有的自然群体为材料（如地方品种、育成品种、种质资源等），无需构建专门的作图群体, 花费的时间少。Exceptions: NAM, MAGIC 基于历史上累积的重组事件，定位的精度高，可达到单基因的水平。可以同时检测同一座位的多个等位基因，便于发掘优良的等位基因。特别适合于多年生木本植物如果树、林木等异花授粉植物。群体结构指的是一个群体内存在亚群的情况。亚群的混合使整个群体的LD 强度增强,可能导致不连锁的基因多态性位点与性状的关联,从而得出假阳性结果。选择LD 程度高的群体进行全基因组关联分析,如具有瓶颈效应的群体，可减少使用的标记数量。连锁分析和关联分析相结合对特定位点进行研究。用实验设计和多种统计方法消除群体结构关联分析的假阳性LD 是由突变产生的多态性形成的,因重组的发生而被打破。由此可见,突变和重组是影响LD 的重要因素。其他生物因素和历史因素，例如物种交配体系、染色体位置、群体大小、基因或染色体片段所受的选择强度、遗传漂变等也影响LD 的程度和分布。关联分析(association analysis)，又称连锁不平衡作图(LD mapping)或关联作图(association mapping)，是利用不同基因座等位变异(基因)间的连锁不平衡关系，进行标记与性状的相关性分析，以达到鉴定特定目标性状基因(或染色体区段)的目的数量性状的分析方法1. 利用遗传连锁图进行QTL定位2. 用关联分析法进行QTL定位(关联分析是一种以连锁不平衡为基础，鉴定某一群体内目标性状与遗传标记或候选基因关系的分析方法。3. QTL定位的常用分离群体:F2，BC1，DH（双单倍体群体），RIL4. 用遗传分析法进行QTL定位的缺点:构建分离群体时，由于杂交和自交次数的限制，发生的重组次数有限，QTL作图的精度一般在10-30cM 如果控制某性状的位点在两个亲本中存在相同的等位基因，在分离群体中该位点控制的性状没有差异的，此时常规QTL分析的方法不能鉴定出该QTL二、关联分析的原理若连锁的两个基因座位上的等位基因分别为A、a和B、b，它们频率分别为pai (A、a、B、b) ；组成的单倍型有AB 、Ab 、aB 和ab，这些单倍型的频率分别为pai(AB/Ab/aB/ab)；若pai(AB)pai(A)pai(B),则表明A/B位点存在LD。即当位于某一座位的特定等位基因与同一